针对您提出的问题，即“孩子没出生时爸爸犯强奸罪，孩子出生后能否剥夺其父亲监护权”，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

一、监护权的基本原则

首先，需要明确的是，父母是未成年子女的法定监护人，这一地位具有优先性和当然性。监护权不仅是一种权利，更是一种法定义务，父母有责任抚养、教育和保护未成年子女。

二、撤销监护权的法定情形

然而，在特定情况下，监护人的资格是可以被撤销的。根据《最高人民法院、最高人民检察院、公安部、民政部关于依法处理监护人侵害未成年人权益行为若干问题的意见》第三十五条的规定，以下情形之一出现时，人民法院可以判决撤销监护人资格：

1. 监护人伤害未成年人；
2. 监护人拒不履行监护职责，使未成年人流离失所；
3. 监护人利用、教唆未成年人犯罪；
4. 监护人有吸毒、赌博、长期酗酒等行为，使未成年人处于困境或危险状态。

特别地，如果监护人因刑事犯罪（如强奸罪）被判处有期徒刑，且该犯罪行为直接或间接对未成年人造成了严重伤害或潜在威胁，这通常会被视为严重侵害未成年人权益的行为，从而满足撤销监护人资格的条件。

三、您所提问题的具体分析

在您所描述的情况下，孩子的父亲在孩子未出生时犯下了强奸罪。这一行为本身虽然不直接针对孩子，但强奸罪作为严重的刑事犯罪，往往伴随着对受害者（可能包括未来孩子的母亲）的身心伤害，以及可能对孩子未来成长环境的负面影响。如果这一犯罪行为被法院认定，且父亲因此被判处有期徒刑，那么在他服刑期间，显然无法履行监护职责。

进一步地，如果法院认为父亲的犯罪行为对孩子的成长环境构成了严重威胁，或者父亲在服刑期间及服刑后仍表现出不适合担任监护人的其他行为（如拒不悔改、继续危害社会等），那么有关个人或组织（如孩子的母亲、其他亲属、儿童福利机构等）可以依法向法院申请撤销其监护人资格。

四、撤销监护权后的义务与恢复

1. 义务：即使监护人资格被撤销，父母仍需继续履行对子女的抚养义务，包括支付抚养费等。
2. 恢复：在特定条件下（如父母确有悔改表现，且未对子女实施故意犯罪），经申请并尊重子女真实意愿的前提下，法院可以视情况恢复其监护人资格。但这一规定主要适用于父母、子女关系，且对于性侵等严重犯罪行为，一般不得判决恢复监护人资格。

五、结论与建议

综上所述，在您所描述的情况下，如果孩子的父亲因强奸罪被判处有期徒刑，且该犯罪行为被法院认为对孩子的成长环境构成了严重威胁或父亲表现出不适合担任监护人的其他行为，那么有关个人或组织可以依法向法院申请撤销其监护人资格。

建议：

1. 收集相关证据，证明父亲的犯罪行为对孩子的成长环境构成了威胁或父亲无法履行监护职责；
2. 咨询专业律师，了解具体的法律程序和申请流程；
3. 在律师的指导下，向法院提交撤销监护人资格的申请，并附上相关证据和理由。

希望以上分析能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时告诉我。