结论：实发工资大于合同工资，公司一般不能直接要回，但需视具体情况而定。以下从不同角度进行分析：

1. 合同约定与实际履行

   • 合同约定：劳动合同中约定的工资是双方协商一致的结果，具有法律约束力。公司应按照合同约定支付工资。
   • 实际履行：如果公司实际支付的工资高于合同约定，这通常被视为公司对员工的额外福利或奖励，而非合同义务。在一般情况下，公司不能因实际支付高于合同工资而要求员工返还。

2. 公司要求返还的合法性

   • 无合法依据：除非公司能证明多支付的工资是由于计算错误、重复支付或其他非员工过错导致的，且员工存在不当得利的情况，否则公司要求员工返还多支付的工资可能缺乏合法依据。
   • 不当得利：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，如果员工确实因公司的错误而获得了不应得的利益（即不当得利），公司有权要求员工返还。但在此情况下，公司需要承担举证责任，证明多支付工资是由于其自身的过错导致的。

3. 实际操作中的建议

   • 沟通协商：如果公司发现多支付了工资，首先应与员工进行沟通协商，了解原因并寻求解决方案。在大多数情况下，通过友好协商可以达成双方都能接受的解决方案。
   • 法律途径：如果协商无果，且公司确实有证据证明多支付工资是由于员工的过错或不当行为导致的（这种情况较为罕见），公司可以考虑通过法律途径解决。但在此之前，公司应仔细评估法律风险和成本效益。

4. 特殊情况下的处理

   • 奖金或提成：如果多支付的工资实际上是奖金或提成等变动性收入，且公司有明确的规章制度或合同约定关于奖金或提成的支付条件和方式，那么公司可能需要根据这些规定来处理多支付的问题。
   • 员工离职：在员工离职时，如果公司发现多支付了工资，且员工尚未领取或已领取但未使用（如未消费的福利金等），公司可以与员工协商扣除或要求返还。但同样需要遵循合法、合理、公平的原则。

法律背景与建议：

• 在处理此类问题时，公司应严格遵守相关法律法规和劳动合同约定，确保自身行为的合法性和合理性。
• 如果公司确实需要要求员工返还多支付的工资，应首先与员工进行沟通协商，并尽量通过友好方式解决争议。
• 如果协商无果或争议较大，公司可以考虑咨询专业律师或法律机构，以获取更具体的法律建议和帮助。

可能法律后果：

• 如果公司未经合法程序或缺乏合法依据而要求员工返还多支付的工资，可能会引发劳动争议或法律纠纷，对公司的声誉和形象造成负面影响。
• 在极端情况下，如果公司采取不当手段（如威胁、恐吓等）要求员工返还工资，还可能面临法律制裁和行政处罚。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。