结论：员工在这种情况下一般不算诈骗。

分析：

1. 诈骗的定义： 诈骗是指以非法占有为目的，使用欺骗方法，骗取数额较大的公私财物的行为。在这个场景中，老板使用银行卡给员工转账工资5000元，并没有提及员工使用了欺骗方法或非法占有为目的来获取这笔钱。因此，从诈骗的定义出发，员工的行为并不符合诈骗的构成要件。

2. 工资支付的合法性： 老板通过银行卡给员工转账工资，这是一种合法的工资支付方式。只要老板确实欠员工工资，并且按照约定的金额和时间进行了支付，那么这种行为就是合法的，不存在诈骗的问题。

3. 可能的误解或纠纷： 当然，如果员工和老板之间存在关于工资数额、支付时间等方面的争议或误解，这并不构成诈骗。这种情况下，双方应该通过协商、调解或法律途径来解决纠纷，而不是将问题定性为诈骗。

4. 特殊情况： 如果员工通过伪造工作记录、虚报工作时间等手段，欺骗老板使其支付了不应支付的工资，并且这种行为具有非法占有的目的，那么这种行为可能构成诈骗。但在这个问题中，并没有提及员工有这样的行为。

建议：

• 如果员工和老板之间关于工资支付存在争议或误解，建议双方首先进行友好协商，尝试达成一致意见。
• 如果协商无果，可以考虑通过劳动调解委员会或劳动仲裁机构进行调解或仲裁。
• 如果问题仍然无法解决，员工可以向法院提起诉讼，维护自己的合法权益。

总结：

在老板使用银行卡给员工转账工资5000元的情况下，员工一般不算诈骗。如果双方存在争议或误解，应该通过合法途径来解决纠纷，而不是将问题定性为诈骗。如果有任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。