非法营运扣驾驶证的后果主要取决于具体情况，非法营运行为本身通常不会直接导致驾驶证被扣，但在查处过程中若驾驶员存在交通违法行为，或非法营运情节严重，则驾驶证有可能被扣留甚至吊销。以下是对此问题的详细分析：
非法营运的定义与主要处罚
- 非法营运是指未依法取得营运权而实施营运行为，即未按规定领取有关主管部门核发的营运证件和超越核定范围进行经营。
- 对于非法营运行为，交通运输管理部门是主要的执法部门，其处罚手段主要是针对营运相关，如罚款、暂扣或吊销营运证件等。具体罚款金额会根据非法营运的次数、是否造成严重后果等因素有所不同。
驾驶证扣留的情况
- 在查处非法营运的过程中，如果驾驶员同时存在交通违法行为，如无证驾驶、闯红灯、超速等违反《道路交通安全法》的行为，交警部门有权依法扣留驾驶证，并依据具体违法情形进行相应处罚。
- 根据《道路交通安全法》的相关规定，执行职务的交通警察认为应当对道路交通违法行为人给予暂扣或者吊销机动车驾驶证处罚的，可以先予扣留机动车驾驶证，并在二十四小时内将案件移交公安机关交通管理部门处理。
驾驶证吊销的情况
- 如果非法营运行为严重，如多次违法、造成重大安全事故等，驾驶员的驾驶证可能会被吊销，这意味着他们在一定时间内或永久不能从事驾驶工作。
- 驾驶证被扣留后，道路交通违法行为人应当在十五日内到公安机关交通管理部门接受处理。无正当理由逾期未接受处理的，驾驶证也可能会被吊销。
法律建议：
- 驾驶员应严格遵守交通法规，避免参与非法营运活动，以免面临不必要的法律风险和处罚。
- 在驾驶过程中，务必遵守交通规则，避免任何形式的交通违法行为，以保护自己的驾驶证不被扣留或吊销。
- 如果已经面临非法营运的指控或处罚，或者驾驶证被扣留或吊销，建议及时向我咨询，以获取准确的法律帮助和指导。
可能后果举例：
- 假设某驾驶员因非法营运被交通运输管理部门查处，同时被发现存在超速行驶的交通违法行为，那么该驾驶员不仅可能面临非法营运的罚款，还可能因超速行驶被交警部门扣留驾驶证，并依据超速的具体情形接受相应处罚。
- 如果某驾驶员多次非法营运且造成重大交通事故，那么其驾驶证很可能会被吊销，且可能面临更严重的法律责任。
总之，非法营运扣驾驶证的后果取决于多种因素，包括是否伴随交通违法行为以及非法营运的严重程度等。因此，驾驶员应时刻保持警惕，确保合法合规地从事道路运输活动。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。