结论前置：

1. 非法营运行为本身通常不会直接导致驾驶证被扣，但若在查处过程中驾驶员存在交通违法行为，或非法营运情节严重，则驾驶证有可能被扣留甚至吊销。

详细分析：

非法营运的定义与主要处罚

非法营运，指的是未依法取得营运权而实施营运行为，这包括未按规定领取有关主管部门核发的营运证件，以及超越核定范围进行经营。对于这类行为，交通运输管理部门是主要的执法部门，其处罚手段主要针对营运相关方面，如罚款、暂扣或吊销营运证件等。具体罚款金额会根据非法营运的次数、是否造成严重后果等因素有所不同。

驾驶证扣留的情况

在查处非法营运的过程中，如果驾驶员同时存在交通违法行为，例如无证驾驶、闯红灯、超速等违反《道路交通安全法》的行为，交警部门有权依法扣留驾驶证，并依据具体违法情形进行相应处罚。根据《道路交通安全法》的相关规定，执行职务的交通警察认为应当对道路交通违法行为人给予暂扣或者吊销机动车驾驶证处罚的，可以先予扣留机动车驾驶证，并在二十四小时内将案件移交公安机关交通管理部门处理。

举例说明：假设某驾驶员未取得营运资格而从事客运活动，同时在运营过程中闯红灯被交警查获。此时，交警部门不仅会对其非法营运行为进行处罚，还会因其闯红灯的交通违法行为而扣留其驾驶证。

驾驶证吊销的情况

如果非法营运行为严重，如多次违法、造成重大安全事故等，驾驶员的驾驶证可能会被吊销。这意味着他们在一定时间内或永久不能从事驾驶工作。此外，驾驶证被扣留后，道路交通违法行为人应当在十五日内到公安机关交通管理部门接受处理。无正当理由逾期未接受处理的，驾驶证也可能会被吊销。

举例说明：某驾驶员长期从事非法营运活动，且多次因交通违法行为被处罚。在一次严重的交通事故中，该驾驶员被查出存在多项交通违法行为，且事故后果严重。此时，公安机关交通管理部门可能会吊销其驾驶证，以示惩戒。

总结与建议： 从事道路运输活动必须依法取得营运权，并严格遵守相关法律法规。在运营过程中，驾驶员应确保自身行为符合交通法规要求，避免任何形式的交通违法行为。这样不仅可以避免不必要的法律风险和处罚，还能保障自身和他人的道路交通安全。如果你或你身边的人面临非法营运的指控或处罚，或者有任何关于交通运输领域的法律问题，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助和指导。