关于行贿三十一万但退了二十九万如何认定的问题，这主要涉及到行贿罪的犯罪数额认定以及退赃情节对量刑的影响，以下从这两个方面进行详细分析：
行贿罪的犯罪数额认定：
- 行贿罪的犯罪数额通常是指行贿人实际给予受贿人的财物数额。在你所描述的情况中，行贿人原本意图行贿三十一万，这是其行贿的初始数额。
- 然而，行贿人后来退了二十九万，这部分退还的金额在犯罪数额的认定上需要仔细分析。一般来说，如果退赃行为发生在行贿行为完成之后，且退赃是出于自愿、主动，而非被追诉或被迫退赃，那么这部分退还的金额可能不会从行贿总额中扣除，因为行贿行为已经构成既遂。但具体是否扣除，还需根据案件的具体情况、退赃的时间点、退赃的动机等因素综合判断。
- 在司法实践中，如果退赃行为能够证明行贿人主观恶性较小，或者对受贿人造成了较小的实际影响，法院在量刑时可能会考虑这一情节，对行贿人从轻或减轻处罚。但这并不意味着退还的金额会直接从犯罪数额中扣除。
退赃情节对量刑的影响：
- 退赃是量刑时的一个重要考虑因素。根据《中华人民共和国刑法》及相关司法解释，对于犯罪后积极退赃、减少损害结果发生的，可以酌情从宽处理。
- 在你所描述的情况中，行贿人退了二十九万，这显示了其有一定的悔罪表现。法院在量刑时，会综合考虑行贿的数额、行贿的目的、行贿的手段、行贿的后果以及退赃的情节等因素，来决定对行贿人的具体刑罚。
- 如果行贿人能够如实供述自己的罪行，积极配合调查，且退赃行为确实减少了损害结果的发生，那么法院在量刑时可能会给予一定的从轻或减轻处罚。
法律建议：
- 如果你或你身边的人涉及此类案件，建议尽快咨询专业律师，以便更准确地了解案件的法律性质和可能的法律后果。
- 在处理此类案件时，应积极配合司法机关的调查，如实供述自己的罪行，并尽可能提供有利于自己的证据和情节，以争取从轻或减轻处罚。
- 同时，也应注意保护自己的合法权益，避免在调查过程中受到不必要的侵害。
可能面临的法律后果：
- 如果行贿行为被认定构成犯罪，行贿人可能面临有期徒刑、拘役或罚金等刑罚。
- 具体刑罚的轻重将取决于行贿的数额、情节以及退赃等因素的综合考量。
总之，行贿三十一万但退了二十九万的情况在犯罪数额认定和量刑上都需要综合考虑多个因素。如果你或你身边的人涉及此类案件，请务必及时咨询专业律师以获取更准确的法律建议。