结论前置：医院要求建立执业药师证注册档案是合法的，且这一要求具有合理的依据和目的。

1. 法律法规依据：

• 根据《中华人民共和国药品管理法》及相关实施条例，医疗机构在使用执业药师时，需要确保药师具备相应的资质，并对其进行有效的管理。建立档案是管理药师资质和执业行为的一种重要方式，有助于确保药师在执业过程中遵守法律法规，保障患者用药安全。

2. 医院管理需求：

• 医院作为医疗机构，对药师的管理是其内部管理的重要组成部分。建立执业药师证注册档案，可以方便医院对药师进行资质审核、继续教育管理、执业行为监督等，从而提高医院的药事管理水平，保障医疗质量。

3. 药师权益保障：

• 对于药师而言，建立档案也有助于保障其合法权益。档案中记录的药师的执业经历、培训情况、考核成绩等信息，可以作为药师晋升、评优、续聘等的重要依据。同时，档案也是药师在执业过程中发生纠纷时的重要证据。

4. 实际操作中的注意事项：

• 医院在建立执业药师证注册档案时，应确保档案内容的真实性和完整性，不得随意篡改或伪造。
• 档案应妥善保管，防止泄露药师的个人隐私信息。
• 药师应积极配合医院建立档案的工作，提供真实、准确的个人信息和执业经历。

5. 可能的法律后果：

• 如果医院未按照法律法规要求建立执业药师证注册档案，或者档案内容不真实、不完整，可能会面临行政处罚或法律责任。
• 如果药师拒绝配合医院建立档案或提供虚假信息，也可能会影响其执业资格和职业发展。

建议：

• 作为执业药师，您应了解并遵守相关法律法规和医院的管理规定，积极配合医院建立执业药师证注册档案。
• 如果您对医院建立档案的具体要求或程序有疑问，可以向医院的药事管理部门或人力资源部门咨询，以确保您的权益得到保障。

如有其他关于医疗医患领域的法律问题，也可以直接向我咨询。