职业病认定后，如果有疑问且存在合法合理的理由，是可以推翻并重新认定的。以下从不同角度为你详细分析：

法律依据与重新认定的条件

根据《职业病防治法》的相关规定，职业病诊断、鉴定过程中，在确认劳动者职业史、职业病危害接触史时，当事人对劳动关系、工种、工作岗位或者在岗时间有争议的，可以向当地的劳动人事争议仲裁委员会申请仲裁；接到申请的劳动人事争议仲裁委员会应当受理，并在三十日内作出裁决。同时，如果劳动者或用人单位对职业病诊断机构作出的职业病诊断结论有异议，可以在接到职业病诊断证明书之日起三十日内，向职业病诊断机构所在地设区的市级卫生行政部门申请鉴定。对设区的市级职业病诊断鉴定委员会的鉴定结论仍有异议的，可以在接到鉴定书之日起十五日内，向省、自治区、直辖市人民政府卫生行政部门申请再鉴定。省级职业病诊断鉴定委员会的鉴定为最终鉴定。

重新认定的条件主要包括：

1. 存在新的证据：例如，有新的医学证据表明原诊断可能存在错误，或者有新的工作记录证明劳动者的职业史、职业病危害接触史与原诊断不符。
2. 原诊断程序违法：如果原职业病诊断过程中存在程序违法的情况，如未依法告知劳动者相关权利、未依法组织诊断等，也可能成为重新认定的理由。
3. 对原诊断结论有异议：劳动者或用人单位对原职业病诊断结论有合理的异议，且能够提供相应的证据或理由支持其异议。

重新认定的流程

1. 提出申请：劳动者或用人单位需要在规定的期限内，向相应的卫生行政部门提出重新认定的申请，并提交相关的证据或理由。
2. 受理与审查：卫生行政部门在收到申请后，会进行受理和审查，决定是否启动重新认定程序。
3. 组织鉴定：如果决定重新认定，卫生行政部门会组织职业病诊断鉴定委员会进行鉴定。鉴定委员会会依据相关的医学知识、职业病诊断标准等，对劳动者的职业病情况进行重新评估。
4. 出具鉴定结论：鉴定委员会在完成鉴定后，会出具鉴定结论。该结论将作为职业病认定的最终依据。

注意事项与风险提示

1. 及时提出申请：劳动者或用人单位需要在规定的期限内提出重新认定的申请，否则可能会丧失重新认定的机会。
2. 准备充分的证据：在提出申请时，需要准备充分的证据或理由支持其异议，否则可能会影响重新认定的结果。
3. 了解重新认定的风险：重新认定并不意味着原诊断结论一定会被推翻。如果重新认定的结果与原诊断结论一致，劳动者或用人单位需要承担相应的法律后果。

实际案例参考

在实际操作中，已经有多起职业病认定被推翻并重新认定的案例。例如，某劳动者在原诊断中被认定为患有某种职业病，但后续通过医学检查发现其症状与另一种疾病更为吻合。在提供了新的医学证据后，该劳动者成功申请了重新认定，并最终获得了与原诊断不同的结论。

总结来说，职业病认定后如果有疑问且存在合法合理的理由，是可以推翻并重新认定的。但重新认定需要遵循一定的流程和条件，并需要准备充分的证据或理由支持其异议。如果你在这方面有进一步的疑问或需要具体的法律帮助，可以直接向我咨询。