员工工资主要由与其建立劳动关系的用人单位发放。这是基于《劳动法》等相关法律法规的明确规定，旨在保障员工的合法权益。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、常规情况下的工资发放
企业：
- 无论是有限责任公司、股份有限公司、合伙企业还是个人独资企业，作为用人单位，都需按照与员工签订的劳动合同约定支付工资。
- 企业通常会制定明确的工资支付制度，包括工资的计算方式、支付时间、支付形式等。例如，多数企业会选择每月固定日期通过银行转账方式将工资发放至员工工资卡中。
个体经济组织：
- 如个体工商户，在雇佣员工时，同样需承担工资发放责任。
- 支付方式可能因经营状况而异，但通常包括现金、银行转账等方式。
民办非企业单位：
- 如民办学校、民办医院、民办科研机构等，也需按照规定向员工发放工资。
- 工资的计算方式及支付周期可能依据单位性质及员工工作内容有所不同。
二、特殊情形下的工资发放
劳务派遣：
- 在劳务派遣关系中，涉及三方主体：劳务派遣单位、用工单位、被派遣劳动者。
- 劳务派遣单位作为用人单位，与被派遣劳动者签订劳动合同并承担工资支付责任。
- 用工单位则根据与劳务派遣单位的协议支付相关费用，但不直接向被派遣劳动者发放工资。
用人单位合并、分立：
- 当用人单位发生合并或分立时，原劳动合同继续有效，由承继其权利和义务的用人单位履行，并承担工资发放责任。
- 例如，A公司与B公司合并为C公司，A公司原员工的工资将由C公司负责发放。
用人单位被承包：
- 若承包人具备用工主体资格，则自行承担工资发放责任。
- 若承包人不具备用工主体资格，则由发包组织与承包人承担连带支付责任。例如，建筑公司将工程发包给不具备用工主体资格的包工头，若包工头拖欠工人工资，建筑公司需与包工头共同承担连带责任。
三、法律建议与注意事项
员工角度：
- 了解工资发放的主体和方式有助于更好地维护自己的权益。在遇到工资问题时，可以明确知道应该向谁追讨以及采取何种措施。
- 建议劳动者在签订劳动合同时仔细阅读条款，明确工资支付相关事宜，如工资的计算方式、支付时间、支付形式等，以避免后续纠纷。
用人单位角度：
- 明确工资发放的责任和义务有助于规范薪资管理，避免法律风险。
- 选择合适的工资发放方式也可以提高管理效率，降低管理成本。例如，通过银行转账方式发放工资可以减少现金管理的风险和成本。
遇到工资问题时的解决途径：
- 如遇工资发放问题，建议首先与用人单位协商解决。
- 协商不成时，可依法向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自身合法权益。
综上所述，员工工资的发放主体及方式因用人单位类型及劳动关系形态的不同而有所差异。但无论如何，用人单位都有义务按时足额支付员工的工资。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。