结论：能否直接将逾期产生的几千块违约金还进去，需分情况讨论，具体如下：
- 若合同有明确约定且违约金计算合法合理
- 从合同履行角度：如果双方签订的合同中明确约定了逾期违约金的具体计算方式、支付时间等条款，并且该违约金的计算没有超出法律规定的合理范围（根据《民法典》及相关司法解释，当事人约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少，一般认为超过造成损失的30%可能被认定为过分高于），那么在这种情况下，你是可以直接按照合同约定将逾期本金以及这几千块违约金一并还进去的。这属于按照合同约定履行自己的义务，有助于避免进一步的法律纠纷和可能产生的更高费用。
- 从实际操作角度：你可以通过与合同相对方（如债权人）沟通确认还款账户等信息，然后按照其要求的方式进行还款，最好保留好还款凭证，如转账记录、收据等，以证明你已经履行了还款义务。
- 若合同约定的违约金过高或存在争议
- 协商解决：如果你认为合同中约定的违约金过高，超出了自己能够承受的范围或者明显超出了债权人因你逾期所遭受的实际损失，你可以先与债权人进行协商，尝试达成一个双方都能接受的违约金支付方案。在协商过程中，你可以提供相关证据，如市场行情、类似案例等，以支持你的观点，争取降低违约金金额。
- 法律途径：如果协商不成，你可以通过法律途径来解决。你可以向人民法院提起诉讼或者根据合同中的仲裁条款申请仲裁，请求法院或仲裁机构对违约金的数额进行调整。在诉讼或仲裁过程中，法院或仲裁机构会根据实际情况，综合考虑合同的履行情况、当事人的过错程度以及预期利益等因素，来确定合理的违约金数额。
- 若合同对违约金约定不明确
- 协商补充约定：如果合同中没有明确约定逾期违约金的计算方式、支付时间等条款，那么双方可以协商补充约定违约金的相关事项。在协商过程中，你可以根据自己的实际情况和承受能力，与债权人就违约金的数额、支付方式等达成一致意见，并签订补充协议。
- 参照法律规定：如果双方无法就违约金达成补充约定，根据《民法典》的规定，当事人就有关合同内容约定不明确，依据前条规定仍不能确定的，受损害方根据标的的性质以及损失的大小，可以合理选择请求对方承担修理、重作、更换、退货、减少价款或者报酬等违约责任。对于逾期违约的情况，债权人可以要求你赔偿因其逾期所遭受的实际损失，但需要提供相应的证据证明损失的具体数额。在这种情况下，你可以与债权人协商确定赔偿金额，如果协商不成，也可以通过法律途径解决。