结论：工资拖欠三年申请劳动仲裁，在特定条件下仍然可能有用，但存在时效限制的风险，需结合具体情况判断。以下从时效规定、仲裁流程、实际效果及应对策略等角度详细分析：

一、劳动仲裁的时效限制：三年拖欠可能面临部分主张不被支持的风险

根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或应当知道权利被侵害之日起计算。但存在两种例外情形：

1. 拖欠劳动报酬的特殊规定：若争议涉及“拖欠劳动报酬”，且劳动者在劳动关系存续期间提出主张，时效不受一年限制；但若劳动关系已终止，则需在终止之日起一年内提出。
2. 时效中断与重新计算：若劳动者在拖欠工资期间曾向用人单位主张权利（如协商、投诉等），或用人单位承诺支付但未履行，时效可从中断时点重新计算一年。

关键点：若您在三年拖欠期间未采取任何维权行动（如协商、投诉等），且劳动关系已终止超过一年，则仲裁机构可能以“超过时效”为由驳回部分或全部请求；若劳动关系仍存续，或存在时效中断情形，则仍可主张权利。

二、劳动仲裁的流程与证据要求：需充分准备以支持主张

即使面临时效风险，若决定申请仲裁，仍需按法定流程推进：

1. 提交申请：需准备身份证、劳动合同、工资条、银行转账记录、考勤记录等证据，证明劳动关系及拖欠工资的事实。若用人单位否认劳动关系，还需提供工作证、同事证言等辅助证据。
2. 受理审查：仲裁委员会将审查是否符合受理条件（如时效、管辖权等）。若认为超过时效，可能直接驳回申请。
3. 开庭审理：双方需出庭陈述事实、提供证据并辩论。若用人单位无法提供反证（如工资发放记录），仲裁庭可能支持您的主张。
4. 裁决执行：若裁决用人单位支付工资，但其拒不履行，您可向法院申请强制执行（如查封财产、限制高消费等）。

建议：即使时效存在风险，仍建议提交仲裁申请。若仲裁委未主动审查时效，或您能证明时效中断，仍可能获得支持；即使部分请求被驳回，也可通过后续诉讼或协商争取权益。

三、实际效果与替代方案：多途径维权降低风险

1. 仲裁的直接效果：若仲裁委支持您的请求，用人单位需支付拖欠工资及可能的赔偿金（如《劳动合同法》第八十五条规定的50%-100%赔偿金）。
2. 诉讼作为补充：若对仲裁结果不服，可在收到裁决书之日起15日内向法院起诉，通过诉讼程序继续维权（诉讼时效为三年，但仲裁是前置程序）。
3. 行政投诉与协商：在申请仲裁前，可先向当地劳动监察大队投诉（时效要求较宽松），通过行政压力促使用人单位支付工资；同时，可尝试与用人单位协商分期支付或书面确认欠款金额，为后续仲裁/诉讼提供证据。

四、操作建议：分步骤行动以最大化权益

1. 立即收集证据：整理所有能证明劳动关系及拖欠工资的材料（如合同、工资条、聊天记录等），并制作证据清单。
2. 咨询专业意见：向律师或法律援助机构咨询，评估时效风险及证据充分性，制定维权策略。
3. 优先协商或投诉：尝试与用人单位协商解决方案，或向劳动监察大队投诉，利用行政手段快速解决。
4. 及时申请仲裁：若协商/投诉无果，且时效风险可控，立即提交仲裁申请；若时效临近届满，可同步准备诉讼材料作为备选。

总结：工资拖欠三年申请劳动仲裁仍有可能有用，但需警惕时效限制。建议您尽快收集证据、咨询专业意见，并优先通过协商或行政投诉解决；若必须仲裁，需做好时效抗辩准备，并考虑后续诉讼途径。如有进一步问题，可直接向我咨询。