结论：工厂因操作失误报废产品而直接从员工工资中扣罚款，是否违法需分情况讨论。以下是具体分析：

1. 若工厂规章制度未经民主程序制定或未公示，直接扣款违法
   根据《劳动合同法》第四条，用人单位制定涉及劳动者切身利益的规章制度（如罚款、赔偿等），需经职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定，且需公示或告知劳动者。若工厂未履行上述程序，直接扣款缺乏合法依据，属于违法行为。

2. 若规章制度合法，但扣款金额超过法定比例，仍违法
   根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按劳动合同约定要求赔偿，但每月扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。若工厂扣款超过此比例，即使规章制度合法，也属违法。

3. 若操作失误系员工故意或重大过失，工厂可主张赔偿，但需通过合法途径
   若员工因故意或重大过失导致产品报废，工厂可依据《民法典》第一千一百六十五条要求赔偿，但需通过协商、劳动仲裁或诉讼等合法途径主张，而非直接从工资中扣款。直接扣款可能被认定为“未及时足额支付劳动报酬”，员工可依据《劳动合同法》第三十八条解除劳动合同并主张经济补偿。

建议：

• 工厂应完善规章制度，确保程序合法并公示；
  
• 扣款前需核实员工过错程度，避免过度追责；
  
• 员工若认为扣款违法，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。