在民事判决书确认的债权发生转移后，通常由债权的受让人向人民法院申请执行。以下是关于这一问题的详细解答：
一、债权转让的合法性与有效性确认
审查债权可转让性：
- 确保所转让的债权不属于《民法典》第五百四十五条规定的不得转让的情形，即债权性质不得转让、当事人约定不得转让、法律规定不得转让。
签订转让协议：
- 债权人与受让人应签订书面债权转让协议，明确转让的债权范围、价格、支付方式等关键条款，并确保协议符合相关法律法规规定，无无效或可撤销情形。
通知债务人：
- 债权人必须通知债务人关于债权的转让，此通知可通过书面、邮件、短信等形式进行，并保留好送达证据。未经通知，债权转让对债务人不发生效力。
二、申请执行的准备与提交
准备申请材料：
- 申请执行书：详细写明申请执行人（债权受让人）与被执行人（原生效判决确定的债务人）的基本信息，申请执行的依据、事项及具体请求，并由申请执行人签名或盖章。
- 债权转让相关文件：包括债权转让协议的原件及复印件、债权转让通知及送达证明、原生效法律文书的副本，以及申请执行人的身份证明。
- 其他相关材料：如被执行人的财产线索、联系方式等，有助于法院更快地找到被执行人并执行其财产。
提交至有管辖权的法院：
- 根据案件情况准确确定管辖法院，一般应向第一审人民法院或者与第一审人民法院同级的被执行的财产所在地人民法院申请执行。如果涉及多个被执行人或财产分布在不同地区，可能需要向多个法院申请执行。
- 向立案庭提交一式多份的申请材料，立案庭将对材料进行初步审查，如材料齐全、符合法定形式，将予以受理。
三、法院审查与执行程序的启动
形式与实质审查：
- 法院将对申请材料进行全面的形式审查和实质审查，核实债权转让的真实性、合法性及申请执行内容与生效法律文书的一致性。
执行立案与措施：
- 经审查符合执行条件的，法院将执行立案，并向被执行人发出执行通知书等法律文书。
- 根据案件情况采取相应的执行措施，如查询、冻结银行账户，查封、扣押、拍卖财产等。
四、应对异议与配合执行
处理异议：
- 若被执行人对债权转让提出异议，执行法院将对其进行审查和处理。申请执行人需积极配合法院工作，提供必要证据和协助。
受让人配合：
- 受让人需按照法律规定的程序和要求，配合执行法院的工作，确保执行程序的顺利进行。
五、注意申请执行时效
- 申请执行期间为二年，自法律文书规定履行期间的最后一日起计算。期间可能因特定事由中止、中断，适用诉讼时效的相关规定。因此，申请执行人需及时行使权利，避免超过时效期间。
示例说明：
假设A公司对B公司享有一笔经民事判决书确认的债权，后A公司将该债权转让给C公司，并签订了书面转让协议，通知了B公司。在此情况下，若B公司未履行判决书确定的义务，C公司作为债权受让人，有权向人民法院申请执行。C公司需准备上述申请材料，并向有管辖权的法院提交申请。法院经审查符合执行条件后，将启动执行程序，采取相应措施执行B公司的财产。
特别提醒：
在债权转让和申请执行过程中，务必确保所有步骤和文件均符合法律法规规定，以避免因程序瑕疵或文件不全而导致执行申请被驳回或执行效果不佳。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。