核心结论：员工对公司资料保管遗失造成公司巨大经济损失，公司可通过内部追责、民事赔偿、劳动仲裁或诉讼以及刑事追责（若符合条件）等途径进行追责。以下是对各途径的详细阐述：

1. 内部追责与纪律处分：

   • 依据：公司可根据内部规章制度、员工手册或劳动合同中的相关规定，对涉事员工进行纪律处分。
   • 措施：包括但不限于警告、记过、降职、解雇等。这些措施旨在维护公司秩序，警示其他员工，并可能作为后续法律追责的依据。
   • 注意：公司需确保内部规章制度或员工手册的制定程序合法，内容合理，且已向员工公示或告知，否则可能面临纪律处分无效的风险。

2. 民事赔偿：

   • 依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，员工因故意或重大过失造成公司损失的，应承担赔偿责任。
   • 流程：公司需收集证据证明员工存在故意或重大过失，如员工未按照公司规定妥善保管资料、未采取必要措施防止资料遗失等。随后，公司可与员工协商赔偿事宜，或通过民事诉讼途径要求员工赔偿损失。
   • 赔偿范围：包括直接经济损失（如资料重制成本、因资料遗失导致的业务中断损失等）和间接经济损失（如因资料遗失导致的客户流失、商誉损害等），但需注意赔偿范围的合理性和可证明性。

3. 劳动仲裁或诉讼：

   • 适用情形：若公司与员工就赔偿事宜无法达成一致，或员工拒绝承担赔偿责任，公司可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或直接向人民法院提起诉讼。
   • 流程：公司需准备充分的证据材料，包括员工过失的证明、损失的计算依据等，并按照法定程序提交仲裁或诉讼申请。
   • 结果：若仲裁或诉讼结果支持公司的赔偿请求，员工需按照裁决或判决结果承担赔偿责任。

4. 刑事追责（如符合条件）：

   • 依据：若员工的行为涉嫌犯罪，如职务侵占罪、故意毁坏财物罪等，公司可向公安机关报案，要求追究员工的刑事责任。
   • 流程：公安机关将进行立案侦查，收集证据，若证据充分，将移送检察机关审查起诉。最终，由法院根据犯罪事实和法律规定作出判决。
   • 注意：刑事追责需满足严格的犯罪构成要件，且公司需承担举证责任。因此，在决定报案前，公司应充分评估证据的充分性和犯罪的可能性。

建议：公司在处理此类事件时，应首先确保内部规章制度的合法性和有效性，以便在追责时有据可依。同时，公司应积极收集证据，证明员工的过失和公司的损失，以便在协商、仲裁或诉讼中占据有利地位。如有需要，公司可寻求专业法律人士的帮助，以确保追责过程的合法性和有效性。