原配和小三已经协议好了，原配又要起诉小三，这在法律上是完全可能的，但具体是否合法以及能否得到法院支持，需根据起诉的具体内容和相关证据来判断。以下是从不同角度的详细分析：
一、起诉的法律依据与可能性
配偶权侵权（若涉及）：
- 虽然我国法律没有明确将“配偶权”列为一项独立的民事权利，但婚姻关系中蕴含着配偶双方相互忠诚、相互尊重的义务。如果原配认为小三的行为侵犯了其配偶权（如破坏婚姻关系、造成精神损害等），理论上可以提起民事诉讼。然而，由于配偶权的界定在法律上较为模糊，此类诉讼在实际操作中可能存在一定难度，且需要充分的证据支持。
财产权益受损：
- 如果原配与小三之间的协议涉及财产处分（如配偶擅自将夫妻共同财产赠与小三），且原配认为该处分行为无效或侵犯了其财产权益，那么原配有权要求小三返还财产。这种情况下，原配的起诉是有法律依据的，且如果证据充分，很可能得到法院的支持。
重婚罪共犯（若涉及）：
- 如果小三与配偶以夫妻名义共同生活，且明知对方已有配偶，可能构成重婚罪的共犯。在这种情况下，原配可以向公安机关报案，由检察机关提起公诉，追究小三的刑事责任。虽然这通常不是由原配直接起诉，但原配可以作为受害者或证人参与诉讼过程。
二、协议的法律效力与影响
- 原配和小三之间的协议，其法律效力取决于协议的具体内容和形式。如果协议内容合法、双方自愿且没有违反法律强制性规定或公序良俗，那么该协议在双方之间是具有法律约束力的。然而，这并不意味着原配不能就协议之外的事项或协议中存在瑕疵的部分提起诉讼。
- 如果协议涉及非法行为（如重婚、财产非法转移等），那么该协议自始无效，原配有权就相关事项提起诉讼。
三、原配起诉小三的注意事项
证据收集：
- 原配在起诉小三前，需要收集充分的证据来证明小三的不当行为以及自己因此遭受的损失。这些证据可以包括聊天记录、转账记录、照片、视频等。证据的合法性和有效性至关重要，非法获取的证据可能不被法院采纳。
法律程序：
- 原配应了解相关法律规定和诉讼程序，确保自己的合法权益得到有效维护。在提起诉讼时，应明确诉讼请求和事实理由，并提供相应的证据支持。
心理调适：
- 面对配偶出轨和小三介入的情况，原配可能会承受巨大的心理压力和痛苦。在寻求法律救济的同时，也应关注自身的心理健康，必要时可以寻求心理咨询或治疗。
四、可能的法律后果
- 如果原配的起诉得到法院支持，小三可能需要承担民事责任（如返还财产、赔偿损失等）或刑事责任（如构成重婚罪时）。
- 如果原配的起诉缺乏法律依据或证据不足，法院可能会驳回其诉讼请求。
总结与建议：
原配在已经与小三达成协议的情况下又要起诉小三，这在法律上是可能的，但具体是否合法以及能否得到法院支持需根据起诉的具体内容和相关证据来判断。我建议你，在决定起诉前，先仔细评估自己的诉求和证据情况，必要时可以向我详细咨询，以便更好地维护自己的合法权益。