结论：提交了被迫离职协议后，劳动者依然有权申请劳动仲裁以维护自身合法权益。
法律背景与依据：
《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条明确规定，因解除劳动合同等发生的争议属于劳动争议范畴，适用本法。这意味着，无论离职协议是自愿签订还是被迫签订，只要涉及解除劳动合同的争议，劳动者都有权申请劳动仲裁。
《中华人民共和国劳动合同法》第二十六条指出，以胁迫手段使对方违背真实意思订立的劳动合同无效或部分无效。这为被迫签订离职协议的无效性提供了法律支撑。如果劳动者能证明离职协议是在被迫情况下签订的，那么该协议可能被认定为无效或部分无效。
被迫离职协议下的仲裁关键要素：
证明被迫情形：
- 劳动者需要收集并整理能够证明自己是在被迫情况下签订离职协议的证据。这些证据可能包括录音录像、证人证言、含有胁迫内容的书面通知或文件、签字时的特殊情况照片或视频等。
- 证据的收集应确保能够清晰展示用人单位的胁迫行为，如威胁内容、胁迫手段及劳动者的无奈状态。
仲裁时效：
- 根据《劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动者应在知道或应当知道其权利被侵害之日起一年内提出仲裁申请。逾期可能丧失胜诉权。因此，劳动者在被迫签订离职协议后，应及时关注自己的权利是否受到侵害，并在法定时间内提出仲裁申请。
明确仲裁请求：
- 劳动者可根据自身情况选择要求确认离职协议无效并恢复劳动关系，或要求用人单位支付违法解除劳动合同的赔偿金等。赔偿金的计算通常依据劳动者的工作年限和工资水平，具体为每满一年支付一个月工资，六个月以上不满一年按一年计，不满六个月支付半个月工资。
仲裁流程与准备：
收集并整理证据：按照上述提到的证据类型，全面收集并整理相关证据材料。
撰写并提交仲裁申请书：
- 明确被申请人（即用人单位）信息。
- 详细阐述仲裁请求及事实和理由，附上相关证据清单。
等待仲裁庭通知并参加庭审：
- 按时到达指定地点参加庭审，如实陈述事实并提供证据。
- 对用人单位的抗辩进行有理有据的反驳。
等待裁决结果：
- 仲裁庭将根据双方提供的证据和法律规定作出裁决。
- 如对裁决结果不满，劳动者可在规定时间内依法提起诉讼。
实际建议：
- 在面对被迫签订离职协议的情况时，劳动者应尽量保持冷静与理智，避免采取过激行为。同时，及时收集并保存相关证据，以备后续仲裁或诉讼之需。
- 劳动者在申请劳动仲裁前，可以向我进一步咨询，了解具体法律法规和仲裁流程，以便更好地准备仲裁申请并提高胜诉率。
综上所述，提交了被迫离职协议后，劳动者依然有权申请劳动仲裁以维护自身合法权益。在申请过程中，劳动者应充分准备证据、明确仲裁请求并遵循仲裁流程，以确保自己的权益得到最大程度的保护。