行政相对人提交申请材料不齐全时，行政机关通常会要求补正材料，具体处理方式如下：

1. 行政机关的告知义务
   根据《中华人民共和国行政许可法》第三十二条，行政机关在收到申请材料后，若发现材料不齐全或不符合法定形式，应当当场或在五日内一次性告知申请人需要补正的全部内容。若未履行告知义务，自收到材料之日起即为受理。
   法律依据：
   

• 《行政许可法》第三十二条：“行政机关对申请人提出的行政许可申请，应当根据下列情况分别作出处理：……（四）申请材料不齐全或者不符合法定形式的，应当当场或者在五日内一次告知申请人需要补正的全部内容，逾期不告知的，自收到申请材料之日起即为受理……”

1. 申请人的补正义务与权利
   申请人需在行政机关指定的期限内补正材料。若逾期未补正，行政机关将作出不予受理决定。但若申请人已按要求补正，行政机关必须依法审查并作出决定。
   注意事项：
   

• 补正期限通常由行政机关根据实际情况确定，但需合理（如15日或30日）；
  
• 若行政机关未明确期限，申请人可主动沟通确认，避免因逾期导致申请被拒。

1. 特殊情形下的处理
   

• 材料瑕疵可当场更正：若申请材料存在笔误、格式错误等轻微瑕疵，行政机关应允许申请人当场更正，无需重新提交。
  
• 材料真实性争议：若行政机关对材料真实性存疑，可要求申请人提供证明或启动调查程序，但不得以此为由拖延受理。
  
• 紧急情况下的容缺受理：部分地区推行“容缺受理”制度，对非关键性材料缺失的申请，可先受理并要求后续补交，但需以地方性法规或政策为依据。

1. 救济途径
   若行政机关未履行告知义务、无正当理由拒绝受理或超期未作出决定，申请人可通过以下方式维权：
   

• 行政复议：向上一级行政机关或本级政府申请复议，要求撤销不予受理决定或责令履行职责；
  
• 行政诉讼：直接向法院提起诉讼，主张行政机关行为违法并要求赔偿损失。
  建议：保留申请材料、补正通知、沟通记录等证据，以便后续维权。

总结：行政相对人遇到材料不齐全时，应第一时间与行政机关确认补正要求，并在期限内完成补正。若行政机关处理不当，可通过复议或诉讼维权。如有具体案件细节需要分析，可直接向我咨询。