同一个当事人在同一时间发现多项违法行为，这些违法行为是可以在同一个案卷中进行处理的，但具体是否合并处理需视违法行为的性质、关联程度及执法实践而定。以下从不同角度为你详细分析：
法律原则与规定
一事不再罚原则的适用：
- 一事不再罚原则主要指的是对当事人的同一个违法行为，不得给予两次以上罚款的行政处罚。这一原则并不禁止对同一当事人的多个违法行为进行合并处理。
- 如果当事人在同一时间实施了多个独立的违法行为，且这些违法行为之间不存在牵连或吸收关系，那么行政机关可以分别对这些违法行为进行处罚，并在必要时将这些处罚合并到一个案卷中。
行政处罚的合并执行：
- 根据《中华人民共和国行政处罚法》的相关规定，行政机关在作出行政处罚决定时，如果当事人有多个违法行为，且这些违法行为都应当受到行政处罚，行政机关可以分别作出行政处罚决定，并在执行时合并执行。
- 合并执行并不意味着将多个违法行为视为一个违法行为进行处罚，而是指在执行阶段，将多个处罚决定合并为一个执行程序，以简化执行流程，提高效率。
实际操作与执法实践
违法行为的关联性与独立性：
- 在实际操作中，行政机关会首先判断当事人的多个违法行为是否具有关联性。如果违法行为之间存在牵连或吸收关系，可能会视为一个违法行为进行处理。
- 如果违法行为之间相互独立，没有直接的关联，那么行政机关通常会分别对这些违法行为进行调查、取证和处罚，并在必要时将这些处罚合并到一个案卷中。
执法效率与程序公正：
- 将同一当事人的多个违法行为合并到一个案卷中处理，可以提高执法效率，减少重复劳动和资源浪费。
- 同时，合并处理也需要确保程序的公正性，保障当事人的合法权益，如陈述申辩权、听证权等。
可能的法律后果与建议
法律后果：
- 如果行政机关将同一当事人的多个违法行为合并到一个案卷中处理，并作出了相应的行政处罚决定，当事人应当认真履行处罚决定，如缴纳罚款、接受行政拘留等。
- 如果当事人对处罚决定不服，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。
建议：
- 对于当事人而言，如果发现自己可能涉及多个违法行为，建议及时咨询专业律师，了解自己的法律权利和义务，以及可能的法律后果。
- 在接受行政机关调查时，当事人应当积极配合，如实陈述事实，提供相关证据，以便行政机关准确判断违法行为的性质和情节，作出公正的处罚决定。
总结来说，同一个当事人在同一时间发现多项违法行为，这些违法行为是可以在同一个案卷中进行处理的，但具体是否合并处理需根据违法行为的性质、关联程度及执法实践来判断。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。