针对施工出现瑕疵且乙方拒不配合的情况，您可以采取以下措施来维护自身权益：

1. 明确瑕疵责任与合同条款

   • 首先，您需要仔细审查施工合同，确认合同中关于工程质量、验收标准、瑕疵处理及违约责任等条款的具体约定。这是判断乙方是否违约以及违约程度的重要依据。
   • 如果合同中有明确规定乙方应承担的质量责任及瑕疵修复义务，而乙方拒不履行，那么乙方已经构成违约。

2. 与乙方协商沟通

   • 在确认乙方违约后，您可以先尝试与乙方进行友好协商，明确指出施工瑕疵的具体情况，要求乙方按照合同约定进行修复或承担修复费用。
   • 协商过程中，您可以保留书面沟通记录，如邮件、短信或书面函件，以备后续法律程序使用。

3. 发送正式通知或律师函

   • 如果协商无果，您可以向乙方发送正式的书面通知，要求其在一定期限内修复瑕疵或承担相应责任。通知中应明确瑕疵情况、修复要求、违约责任及法律后果。
   • 必要时，您可以委托律师发送律师函，以更具法律效力的方式督促乙方履行义务。律师函通常具有更强的威慑力，能够促使乙方重视并尽快解决问题。

4. 寻求第三方调解或仲裁

   • 如果双方仍无法达成一致，您可以考虑寻求第三方调解或仲裁。调解可以由行业协会、调解委员会等机构进行，仲裁则可以根据合同中的仲裁条款或双方协商确定的仲裁机构进行。
   • 调解和仲裁都是相对快速、经济的解决纠纷方式，且仲裁裁决具有法律效力，可以强制执行。

5. 提起诉讼

   • 如果调解或仲裁均无法解决问题，您有权向人民法院提起诉讼，要求乙方承担违约责任，包括修复瑕疵、赔偿损失等。
   • 在诉讼过程中，您需要提供充分的证据证明乙方的违约行为及给您造成的损失，如施工合同、瑕疵照片、修复费用清单、沟通记录等。

6. 注意法律程序与证据保留

   • 在整个处理过程中，您务必注意法律程序的合规性，确保每一步都符合法律规定。
   • 同时，保留好所有相关证据，包括合同、沟通记录、瑕疵照片、修复费用凭证等，这些证据将在后续的法律程序中发挥关键作用。

可能面临的法律后果与风险提示：

• 如果乙方拒不履行法院判决或仲裁裁决，您有权申请强制执行，法院将采取查封、扣押、拍卖等措施强制乙方履行义务。
• 需要注意的是，如果施工瑕疵是由于您自身原因（如设计变更、材料供应问题等）导致的，那么您可能无法要求乙方承担全部责任。因此，在处理纠纷前，务必明确瑕疵责任归属。

建议：

• 在处理此类纠纷时，建议您保持冷静与理性，避免情绪化行为影响纠纷解决。
• 如有需要，您可以随时向我咨询，我将根据您的具体情况提供更详细的法律建议与帮助。