连续三年考核不合格并不直接决定员工一定会被辞退，而是需要根据单位性质、相关法律规定及程序来综合判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、法律依据与适用情形
对于事业单位工作人员：
- 根据《事业单位人事管理条例》，若工作人员年度考核不合格且不同意调整工作岗位，或连续两年年度考核不合格的，事业单位可提前30日书面通知解除聘用合同。连续三年考核不合格且符合前述条件的，事业单位同样有权解除合同。
对于企业等用人单位员工：
- 依据《中华人民共和国劳动法》与《劳动合同法》，若劳动者不能胜任工作，经过培训或调岗后仍不能胜任的，用人单位可以解除劳动合同。但需提前三十日以书面形式通知或额外支付一个月工资，并按工作年限支付经济补偿（每满一年支付一个月工资）。因此，连续三年考核不合格并不直接等同于可以辞退，还需满足不能胜任工作且经培训或调岗后仍不能胜任的条件。
二、不同单位性质的辞退规定
企业等用人单位：
- 若企业规章制度中明确规定了连续三年考核不合格属于严重违反公司制度或不能胜任工作的情形，且该规章制度经民主程序制定并已公示告知员工，则企业可依据此辞退员工，并需支付经济补偿。但企业需确保考核机制的合法性和合理性，不能简单将考核不合格等同于不胜任工作。
国家机关单位（公务员）：
- 根据《公务员法》，连续两年年度考核不称职的公务员将被辞退。因此，在连续三年考核不合格的情况下，机关单位有充分理由进行辞退，但必须严格按照规定程序执行，并确保公务交接和审计等程序的完成。
事业单位：
- 如前所述，依据《事业单位人事管理条例》，连续三年考核不合格且符合特定条件的，事业单位可以解除聘用合同。同时，事业单位应保障员工的知情权等相关权益，并提供申诉途径。
三、实际操作中的注意事项
考核不合格与不胜任工作的区分：
- 用人单位应确保考核机制的合法性和合理性，不能将考核不合格简单等同于不胜任工作。考核不合格可能是多种因素导致的，而不胜任工作则需经过培训或调岗后仍然无法改善才能确定。用人单位在辞退员工前，应充分考虑这一区分，避免违法辞退。
用人单位的义务：
- 在决定辞退之前，用人单位应与员工进行充分的沟通和协商，明确告知绩效考核结果及其可能带来的后果，并听取员工的意见和解释。同时，应考虑提供培训或调整工作岗位的机会，以体现用人单位的人文关怀和合法合规性。
员工的权益保护：
- 员工应了解自己的权益和可能的救济途径。如认为用人单位的辞退行为违法或不公，可以申请劳动仲裁或提起诉讼来维护自己的合法权益。在维权过程中，员工应保留好相关证据，如考核记录、沟通记录等，以便在必要时提供证明。
综上所述，连续三年考核不合格是否会被辞退并非一成不变，而是需要根据具体情况、单位性质以及相关法律法规来综合判断。用人单位在辞退员工时必须遵循合法程序，确保决定的公正性和合法性；同时，员工也应积极了解自己的权益，以便在必要时采取适当的措施来保护自己。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。