侵犯合法权益达成的人民调解协议书，在符合法定条件时是有效的。以下从多个角度进行分析：
一、人民调解协议书的法律效力基础
人民调解协议书是双方当事人在人民调解委员会的主持下，通过平等协商、自愿达成的解决纠纷的协议。根据《中华人民共和国人民调解法》的相关规定，经人民调解委员会调解达成的调解协议，具有法律约束力，当事人应当按照约定履行。这意味着，只要调解协议是双方真实意思的表示，且内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么该协议就具有法律效力。
二、侵犯合法权益时调解协议书的效力
合法性审查：
- 如果调解协议的内容本身不违反法律、行政法规的强制性规定，即使涉及的是侵犯合法权益的纠纷，只要双方自愿达成协议，且协议内容合法，那么该协议就是有效的。
- 例如，双方因合同纠纷产生争议，一方认为另一方侵犯了其合法权益，通过人民调解委员会调解后，双方达成协议，约定了赔偿金额和方式等，只要该协议内容合法，就是有效的。
自愿性审查：
- 调解协议必须是双方自愿达成的，不能存在欺诈、胁迫等情形。如果一方在调解过程中受到欺诈或胁迫，导致非自愿地签订了调解协议，那么该协议可能因缺乏自愿性而被认定为无效。
- 例如，一方利用对方对法律的无知或恐惧心理，通过威胁或欺骗手段使对方签订调解协议，这种情况下，该协议可能因缺乏自愿性而被撤销。
内容合理性审查：
- 调解协议的内容应当合理，不能显失公平。如果调解协议的内容明显偏向一方，导致另一方利益严重受损，那么该协议可能因显失公平而被认定为无效或可撤销。
- 例如，在侵犯知识产权的纠纷中，如果调解协议约定的赔偿金额过低，明显不足以弥补权利人的损失，那么该协议可能因显失公平而被权利人申请撤销。
三、调解协议书的履行与救济
履行义务：
- 一旦调解协议生效，双方当事人就应当按照协议约定履行各自的义务。如果一方不履行协议，另一方可以向人民法院申请司法确认或提起诉讼，要求对方履行协议或承担违约责任。
救济途径：
- 如果调解协议存在无效或可撤销的情形，受损害方可以向人民法院提起诉讼，请求确认调解协议无效或撤销调解协议，并重新解决纠纷。
- 例如，如果调解协议是在欺诈或胁迫下签订的，受损害方可以在知道或应当知道撤销事由之日起一年内，向人民法院提起诉讼，请求撤销调解协议。
四、建议
- 在签订调解协议前，务必仔细审查协议内容：确保协议内容合法、自愿、合理，避免签订存在无效或可撤销情形的协议。
- 如果对调解协议的内容有疑问或不确定：可以咨询专业律师或法律工作者，以获取更准确的法律意见和建议。
- 在履行调解协议过程中：如果遇到对方不履行协议或履行不符合约定的情况，应及时采取法律措施维护自己的合法权益。
总之，侵犯合法权益达成的人民调解协议书在符合法定条件时是有效的。但双方在签订和履行调解协议过程中，应当谨慎对待，确保协议内容的合法性、自愿性和合理性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。