侵害他人合法权益的协议，其效力需根据具体情况来判断，可能无效、可撤销或不影响效力。以下是对此问题的详细分析：
一、协议可能无效的情形
恶意串通损害他人利益：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百五十四条的规定，行为人与相对人恶意串通，损害他人合法权益的民事法律行为无效。这意味着，如果协议双方当事人为了谋取自身利益而故意订立协议，且该协议损害了第三人的合法权益，那么该协议将被认定为无效。
- 例子：甲和乙为了使丙无法获得应得的房屋拆迁补偿款，恶意签订一份虚假的房屋买卖合同，此类合同因损害丙的利益而无效。
违反法律、行政法规的强制性规定或违背公序良俗：
- 协议内容若违反了法律或行政法规的强制性规定，或者违背了社会的基本道德准则（即公序良俗），同样会导致协议无效。
- 例子：一份涉及非法交易或侵犯他人人身权利的协议，显然违反了法律和公序良俗，因此无效。
二、协议可能可撤销的情形
欺诈：
- 依据《民法典》第一百四十八条，若一方以欺诈手段使对方在违背真实意思的情况下签订协议，受欺诈方有权请求法院或仲裁机构撤销该协议。
- 例子：甲将存在严重质量问题的设备冒充合格品出售给乙，乙在不知情下购买，乙有权在知悉撤销事由后一年内申请撤销协议。
胁迫：
- 根据《民法典》第一百五十条，一方或第三方通过胁迫手段迫使对方签订违背真实意愿的协议，受胁迫方同样有权请求法院或仲裁机构撤销。
- 例子：丙威胁丁，迫使其低价转让店铺，丁可在法律框架内寻求协议撤销。
三、不影响协议效力的情形
尽管某些协议的履行可能间接影响他人权益，但若协议双方并无恶意串通等违法行为，且协议内容符合法律法规的其他生效要件，则该协议仍可能被认定为有效。
- 例子：甲将房屋出租给乙，租赁行为后来影响到相邻权人丙的通行便利。然而，若甲与乙在签订协议时对此并不知情，且租赁协议本身系双方真实意思表示，内容合法合规，则该租赁协议依然有效。此时，丙虽受影响，但可通过相邻关系法律规定要求甲或乙采取补救措施。
四、协议无效或被撤销后的法律后果
- 返还财产：因协议取得的财产应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。
- 赔偿损失：有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失；各方都有过错的，应当各自承担相应的责任。
- 收缴非法所得：在某些情况下，如果协议涉及非法活动或违法所得，相关财产可能会被依法收缴。
五、建议
- 签订协议前充分了解：在签订协议前，务必充分了解协议条款，确保协议内容的合法性及真实性。
- 及时咨询：对于可能存在争议的情况，或者你不确定协议是否侵害他人合法权益时，及时向我咨询以获取准确的法律意见。
综上所述，侵害他人合法权益的协议效力需根据具体情况灵活判断。如果你有任何具体的协议或情况需要分析，请直接向我咨询，我会为你提供详细的法律解答。