员工病假期间公司扣钱是否合法，需根据具体情况判断，关键在于扣款行为是否符合法律规定、劳动合同约定以及公司规章制度，且扣款后工资不得低于当地最低工资标准的80%。以下从不同角度为您详细分析：
一、法定医疗期内的病假工资支付规定
法律依据：
- 根据《关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》第59条规定，职工患病或非因工负伤治疗期间，企业应按有关规定支付其病假工资或疾病救济费，该费用可以低于当地最低工资标准，但不得低于最低工资标准的80%。
- 例如，若当地最低工资标准为每月2000元，则企业支付给请病假员工的工资应不低于1600元。
实际操作：
- 在法定医疗期内，公司应按照上述规定支付病假工资，不得随意扣减。如果公司扣款后工资低于当地最低工资标准的80%，则属于违法行为。
二、超出法定医疗期的处理
法律规定：
- 若员工的病假超过了法定的医疗期，且不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作，用人单位可以按照相关规定解除劳动合同。
- 在员工请病假超出法定医疗期期间，公司可以不支付工资，但这需要基于合法的解除劳动合同程序。
注意事项：
- 即使超出法定医疗期，公司在解除劳动合同前也应与员工进行充分沟通，并按照法定程序进行，避免违法解除劳动合同的风险。
三、公司规章制度与劳动合同的约定
规章制度合法性：
- 公司内部关于病假工资的规章制度必须合法合规，且应提前告知员工。如果公司有明确的病假工资制度，并且该制度符合法律法规的规定，也提前告诉了员工，那么按照制度扣钱是合理的。
- 公司不得随意克扣员工病假工资，必须有合理的规章制度作为支撑。
劳动合同约定：
- 如果劳动合同中明确规定了病假期间的扣款方式及比例，并且这些规定符合法律法规，那么按照合同约定进行扣款也是合法的。但无论如何，扣款后的工资都不能低于当地最低工资标准的80%。
四、不合理或不合法的扣钱情况
常见情形：
- 未支付任何病假工资；
- 扣款后工资低于当地最低工资标准的80%；
- 劳动合同或规章制度中无相关约定却擅自扣款；
- 规章制度未经公示或告知劳动者即执行扣款。
应对措施：
- 员工在面对此类情况时，可以要求公司补足差额；如果公司拒绝，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
五、劳动者权益保护与维权途径
证据收集：
- 劳动者应妥善保存劳动合同、病假证明、工资条或银行流水等记录，作为维权时的关键证据。
协商与投诉：
- 首先尝试与公司进行沟通协商，要求纠正不合法的扣款行为。
- 若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉，请求介入调查并处理。
劳动仲裁与诉讼：
- 如劳动监察部门未能解决问题，劳动者可依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 对仲裁裁决不服的，还可以在规定时间内向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
总结与建议：员工在病假期间应了解自己的权益和义务，公司也应依法支付病假工资或疾病救济费。如果公司扣款行为不符合法律规定或劳动合同约定，员工有权采取多种措施维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。