项目设计不合理，确实是可以质疑的。在建设工程合同纠纷中，项目设计的合理性直接关系到工程的质量、安全以及合同双方的权益。以下从几个角度详细分析这一问题：
一、法律依据与合同条款
法律法规：根据《中华人民共和国建筑法》、《中华人民共和国合同法》（现《中华人民共和国民法典》合同编）等相关法律法规，建设工程的设计应当符合国家规定的建设工程质量、安全标准，满足合同约定的要求。如果设计不合理，可能违反了这些法律法规的强制性规定。
合同条款：建设工程合同中通常会明确约定设计的要求、标准以及验收程序等。如果设计不符合合同约定的要求，那么作为合同的一方，你完全有权对设计提出质疑，并要求设计方进行修改或重新设计。
二、质疑的途径与方式
内部沟通：首先，你可以尝试与设计方进行内部沟通，明确指出设计不合理的地方，并提供合理的建议或解决方案。这种方式通常更为高效，有助于维护双方的良好合作关系。
专家论证：如果内部沟通无果，你可以考虑邀请相关领域的专家对设计进行论证。专家的意见往往具有权威性和说服力，可以为你的质疑提供有力的支持。
法律途径：如果设计不合理的问题严重影响到工程的质量、安全或你的合法权益，你还可以考虑通过法律途径来解决。例如，你可以向法院提起诉讼，要求设计方承担违约责任或赔偿责任。
三、质疑的注意事项
证据收集：在质疑设计不合理之前，你需要收集充分的证据来支持你的观点。这些证据可以包括设计图纸、合同条款、专家意见、现场照片等。
合理期限：你需要在合理的期限内提出质疑。如果设计已经完成并经过了验收，你再提出质疑可能会面临更多的困难。
专业评估：对于设计是否合理的判断，往往需要专业的知识和技能。因此，在提出质疑之前，最好先咨询相关领域的专家或律师，以确保你的质疑具有合理性和合法性。
四、可能的法律后果
如果设计确实存在不合理之处，并且你的质疑得到了支持，那么设计方可能需要承担以下法律后果：
修改设计：设计方可能需要按照你的要求或专家的建议对设计进行修改或重新设计。
赔偿损失：如果设计不合理导致了你或第三方的损失，设计方可能需要承担相应的赔偿责任。
行政处罚：如果设计不合理违反了相关法律法规的强制性规定，设计方还可能面临行政处罚。
总结与建议：项目设计不合理是可以质疑的，并且你有多种途径和方式来提出质疑。在质疑之前，你需要收集充分的证据，咨询相关领域的专家或律师，并确保在合理的期限内提出。如果设计确实存在不合理之处，设计方可能需要承担修改设计、赔偿损失或行政处罚等法律后果。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。