环境侵权公益诉讼一般不可以在不同法院分别判决，但在特定情形下可能存在例外。以下从不同角度为你详细分析：
一、一般原则：环境侵权公益诉讼的集中管辖与统一判决
根据《民事诉讼法》及相关司法解释，环境侵权公益诉讼通常遵循集中管辖原则，即由特定的法院（如环境资源专门法院或具有管辖权的基层、中级、高级人民法院）集中审理。这一原则的设立，旨在确保环境侵权案件的审理具有专业性和统一性，避免不同法院对同类案件作出相互矛盾的判决。
在集中管辖的框架下，环境侵权公益诉讼一般会在一个法院进行审理，并作出统一的判决。这有助于维护法律的权威性和一致性，保护环境公共利益。
二、例外情形：可能涉及不同法院判决的情况
尽管集中管辖是原则，但在某些特定情形下，环境侵权公益诉讼可能涉及不同法院的判决。这主要包括以下几种情况：
跨区域环境侵权：当环境侵权行为跨越多个行政区域时，可能涉及多个具有管辖权的法院。在这种情况下，虽然理论上可以由一个法院集中审理，但实践中可能因各种原因（如地方保护主义、案件复杂程度等）导致不同法院分别审理并作出判决。然而，这种情况较为罕见，且通常需要通过上级法院的指定管辖或协调来解决。
多个侵权主体：如果环境侵权行为由多个不同的主体实施，且这些主体分别位于不同的行政区域，那么针对每个侵权主体的诉讼可能由不同的法院审理。在这种情况下，虽然每个诉讼都是独立的，但法院在审理时会考虑整体环境侵权的情况，并可能作出相互协调的判决。不过，这并不意味着每个法院都会对同一环境侵权行为作出独立的判决，而是针对各自管辖范围内的侵权行为进行判决。
上诉与再审程序：在环境侵权公益诉讼的一审判决后，如果当事人不服提起上诉或申请再审，那么二审或再审法院可能会对原判决进行审查并作出新的判决。这种情况下，虽然涉及不同级别的法院，但并非是在不同法院对同一环境侵权行为分别进行初审判决。
三、法律建议与风险提示
遵循集中管辖原则：在提起环境侵权公益诉讼时，应首先了解并遵循集中管辖的原则，选择具有管辖权的法院进行诉讼。这有助于确保案件的审理具有专业性和统一性。
注意案件复杂性：对于跨区域或涉及多个侵权主体的环境侵权案件，应特别注意案件的复杂性，并可能需要通过上级法院的指定管辖或协调来解决管辖问题。
关注判决协调性：如果环境侵权公益诉讼确实涉及不同法院的审理，那么应关注各法院判决之间的协调性，避免出现相互矛盾的判决。这可能需要通过法律程序（如上诉、再审等）或法院之间的协调来解决。
如果你在环境侵权公益诉讼方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。