结论：与公司签协议只盖章不签名，在符合其他生效要件且没有特殊规定或特别约定的情况下，一般是合法有效的。但具体是否有效，还需根据合同的具体条款、相关法律规定以及行业惯例和交易习惯来综合判断。
详细分析：
法律规定层面：
- 根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条的规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这意味着签名、盖章和按指印在合同订立过程中具有同等的法律效力。因此，从法律条文的角度来看，合同只盖章不签名，并不必然导致合同无效。
合同具体条款层面：
- 如果合同中明确规定了必须同时签字和盖章才有效，那么仅盖章而未签字的合同可能无法生效。此时，应严格遵守合同条款，确保合同订立的程序符合约定要求。例如，某些合同可能特别约定“本合同自双方签字并盖章之日起生效”，在这种情况下，仅盖章而未签字则合同未生效。
法律特别规定层面：
- 对于某些特定类型的合同，如涉及重大资产交易、金融借贷等，法律或行政法规可能有特别规定，要求必须同时满足签字和盖章等条件才能生效。在这种情况下，仅盖章可能不足以使合同生效。因此，在签订这类合同时，应特别注意相关法律规定，确保合同订立的程序符合法律要求。
行业惯例与交易习惯层面：
- 在某些行业或交易中，可能存在特定的惯例或习惯，要求合同必须同时由法定代表人或授权代表签字并盖章。遵循这些惯例和习惯有助于减少纠纷，提高交易的稳定性和可靠性。例如，在房地产交易中，通常要求买卖双方签字并盖章以确认合同的效力。
法律建议：
- 仔细审查合同条款：在签订合同时，应仔细审查合同条款，确保内容真实、合法、有效。特别是要注意合同中关于生效条件的约定，确保合同订立的程序符合约定要求。
- 确认合同双方的身份和资质：在签订合同时，应确认合同双方的身份和资质，特别是对方为自然人时，应要求其提供身份证明。对于公司作为合同一方的情况，应确认其是否具有签订合同的权限和资质。
- 尽量既要求盖章也要求签名：为了增加合同的严肃性和可执行性，建议在签订合同时既要求盖章也要求签名。这有助于减少因合同形式问题而引发的纠纷和风险。
- 咨询专业律师：对于重要合同或涉及复杂法律问题的合同，建议咨询专业律师进行审查和把关。作为徐新龙律师，我擅长刑事辩护和合同纠纷领域，可以为你提供专业的法律咨询和帮助。
可能法律后果：
- 如果合同只盖章不签名且不符合上述生效要件或存在特殊规定或特别约定的情况，可能导致合同无效或无法产生预期的法律效果。这可能会给合同双方带来不必要的纠纷和损失。因此，在签订合同时应特别注意合同的形式和生效要件问题。