关于农村房屋父子之间的买卖协议是否受法律保护，这确实是一个涉及多个法律层面的复杂问题。以下是我为您详细梳理的解答：
一、农村房屋买卖协议的法律效力基础
农村房屋买卖协议的法律效力，并非单纯由买卖双方的关系（如父子）决定，而是取决于多个关键因素，包括但不限于买卖双方的身份、购房条件、协议内容的规范性，以及是否符合相关法律法规和政策。
二、父子间农村房屋买卖的有效情形
同一集体经济组织成员间的交易：
- 如果父子双方均属于同一农村集体经济组织成员，且符合宅基地申请和使用条件，那么他们之间的房屋买卖协议在符合其他法定条件的情况下，是受法律保护的。
- 这是因为宅基地属于农民集体所有，同一集体经济组织成员间享有对宅基地的使用权益，成员间的房屋买卖不涉及宅基地使用权在不同集体间的流转。
协议内容规范且自愿签订：
- 无论买卖双方关系如何，协议书必须写得规范，内容明确，双方权利义务清晰，且必须是自愿签订，无强迫或欺诈行为。
- 建议在签订前咨询专业律师，确保协议的合法性，避免未来可能出现的纠纷。
三、父子间农村房屋买卖的无效情形
违反“一户一宅”原则：
- 如果父亲或儿子已经拥有一处宅基地房屋，再购买或出售另一处房屋，可能违反“一户一宅”的原则，导致买卖协议无效。
- “一户一宅”是农村宅基地管理的基本原则，旨在保障农村村民的居住需求。
未经其他共有人同意：
- 如果农村房屋属于家庭共有财产，如夫妻共同共有，那么一方未经另一方同意擅自出售房屋，买卖协议可能被认定无效。
- 根据《民法典》的相关规定，处分共有财产需经占份额三分之二以上的按份共有人或全体共同共有人同意。
涉及非本集体经济组织成员（虽父子关系，但若一方户口已迁出）：
- 如果儿子或父亲的户口已经迁出农村集体经济组织，成为非本集体经济组织成员，那么他们之间的房屋买卖可能因违反宅基地使用权流转的规定而无效。
- 宅基地使用权是集体经济组织成员享有的权利，不允许随意转让给非本集体经济组织成员。
四、建议与总结
咨询专业律师：
- 在进行农村房屋买卖前，建议咨询专业律师或相关部门，了解当地的具体政策和法律法规，确保交易的合法性和有效性。
完善协议内容：
- 确保协议内容规范、明确，双方权利义务清晰，且必须是自愿签订，无强迫或欺诈行为。
遵守相关法律法规和政策：
- 买卖双方应充分了解并遵守相关法律法规及当地政策，特别是关于农村房屋买卖的限制和规定。
总结：农村房屋父子之间的买卖协议是否受法律保护，取决于多种因素，包括买卖双方的身份、购房条件、协议内容的规范性以及是否符合相关法律法规和政策。为确保协议的有效性，建议在签订前进行充分的法律咨询和审查。