农村自建房买卖协议书的法律效力主要取决于交易双方的身份、交易过程是否符合相关法律法规，以及房屋本身是否合法。具体来说，有以下几种情况：
同一集体经济组织成员之间的有效买卖
- 情况说明：在符合规划和宅基地申请条件等规定的情况下，同一集体经济组织成员之间买卖农村自建房屋是有效的。这种买卖没有改变宅基地的集体所有性质，也没有违背宅基地分配的初衷。例如，同村村民之间的房屋买卖，在符合其他法定条件下，协议书是合法有效的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国土地管理法》第六十二条，农村村民一户只能拥有一处宅基地，且面积不得超过规定标准。农村村民建住宅应符合规划，并尽量使用原有宅基地和村内空闲地。同时，《中华人民共和国民法典》第三百六十三条也规定，宅基地使用权的取得、行使和转让，适用土地管理的法律和国家有关规定。
向非本集体经济组织成员出售的无效买卖
- 情况说明：将农村自建房屋卖给非本集体经济组织成员，如城市居民，会导致宅基地使用权流转超出本集体经济组织范围，损害集体利益，违反法律规定。因此，这种买卖协议通常被认定为无效。
- 法律依据：根据《中华人民共和国土地管理法》第九条，宅基地属于农民集体所有。同时，国务院办公厅《关于加强土地转让管理严禁炒卖土地的通知》也明确规定，农民的住宅不得向城市居民出售。
违反规划或未经审批的无效买卖
- 情况说明：如果农村自建房屋违反土地利用总体规划或未经相关部门审批，则该房屋属于违法建筑，其买卖不受法律保护。例如，未取得乡村建设规划许可证或未按照规划进行建设的房屋，其买卖协议可能被视为无效。
- 法律依据：根据《中华人民共和国城乡规划法》第四十一条，在乡、村庄规划区内进行建设需申请乡村建设规划许可证。同时，《中华人民共和国民法典》第一百五十三条也规定，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。
法律建议：
- 确保交易双方身份合法：在进行农村自建房买卖时，务必确认交易双方是否为同一集体经济组织成员，以避免因身份问题导致买卖协议无效。
- 遵守规划和审批程序：确保房屋建设符合土地利用总体规划和村庄规划，并依法取得相关审批手续。未经审批或违反规划的房屋买卖将不受法律保护。
- 签订规范的买卖协议：买卖协议应明确双方的权利义务、房屋状况、交易价格及支付方式等关键条款，并确保协议内容合法、形式合规。必要时，可寻求专业法律人士的帮助来起草或审查协议。
可能产生的法律后果：
- 如果农村自建房的买卖合同违反上述法律规定，如出卖人不是同一集体经济组织成员，或买受人不符合宅基地申请标准，或房屋违反规划或未经审批等，该合同可能被视为无效。
- 合同无效时，卖方需返还房屋价款，买方需返还房屋，并可能涉及装修等增值部分的补偿问题。有过错的一方还应赔偿对方因此受到的损失。
综上所述，农村自建房买卖协议书的法律效力需综合考虑多方面因素。在进行此类交易时，请务必谨慎对待并咨询专业法律人士的意见，以确保交易的合法性和安全性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。