婚假期间不应扣除年终奖，这一行为是不合法的。以下从法律依据、年终奖性质及劳动者权益保护三个方面进行详细分析：

一、明确的法律依据

根据《中华人民共和国劳动法》第五十一条的规定，劳动者在法定休假日和婚丧假期间，用人单位应当依法支付工资。年终奖作为工资的一部分，同样应受此规定约束。因此，用人单位在劳动者休婚假期间应当支付年终奖，而不应扣除。此外，《关于国营企业职工请婚丧假和路程假问题的通知》也强调，职工在批准的婚丧假期间，工资照发，这进一步证实了请婚假不应影响年终奖的发放。

二、年终奖的性质与发放原则

1. 年终奖的性质：年终奖是用人单位自主给予员工的一种福利待遇，虽非强制性义务，但一旦用人单位的规章制度或劳动合同中明确约定了年终奖的发放，就构成了对员工的承诺，必须履行。
2. 发放原则：年终奖属于工资性的劳动报酬，是职工工资的重要组成部分。其发放应遵循公平、公正的原则，不得因员工休婚假等合法假期而扣减。

三、劳动者权益保护与应对措施

1. 权益保护：根据相关法律法规的精神，任何单位不得因结婚等情形降低劳动者的工资待遇，包括年终奖。这是保障劳动者合法权益的重要原则。
2. 应对措施：
   • 协商沟通：如果劳动者遇到请婚假被扣除年终奖的情况，首先应与用人单位进行协商沟通，要求其按照规定支付年终奖。
   • 投诉与仲裁：若协商不成，劳动者可以向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁来维护自己的合法权益。在维权过程中，劳动者可以依据上述法律法规和规章制度，要求用人单位纠正违法行为，并补发被扣除的年终奖。

四、特殊情况说明

虽然一般情况下婚假期间不应扣除年终奖，但如果用人单位的规章制度或劳动合同中有特别约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么按照约定执行也是可能的。不过，这种约定必须具有合理性，且不能严重损害劳动者的合法权益。例如，如果约定因休婚假导致无法完成年度工作任务而影响年终奖发放，且该任务与年终奖直接相关且合理，那么这种约定可能是有效的。但这种情况较为特殊，且需要严格的条件限制。

总结与建议：

婚假期间扣除年终奖的行为通常是不合法的，劳动者应依法维权。为了避免类似纠纷的发生，建议用人单位在制定规章制度时，应明确、合理地规定婚假与年终奖的关系，并确保这些规定不违反法律法规的强制性规定。同时，劳动者在签订劳动合同时，也应仔细审查相关条款，了解自己的权益和义务。如果遇到问题，双方应首先通过协商解决，协商不成时再寻求法律途径解决纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。