若发现制种玉米侵权，可采取以下措施来维护自身权益：

1. 收集侵权证据

   • 固定侵权事实：对侵权行为进行拍照、录像，记录侵权玉米的种植地点、面积、生长阶段等信息。同时，收集侵权人的身份信息，如姓名、联系方式、地址等。
   • 保存相关凭证：保留与制种玉米相关的合同、发票、种子包装袋、标签等，这些凭证可以证明你对该玉米品种的合法权利，以及侵权行为对你造成的损失。
   • 获取专业鉴定：如果可能，委托专业的农业鉴定机构对侵权玉米进行鉴定，确定其是否与你拥有权利的玉米品种相同或相似，以及侵权行为的性质和程度。

2. 与侵权人协商

   • 明确诉求：在协商前，明确自己的诉求，如要求侵权人停止侵权行为、赔偿损失、公开道歉等。
   • 友好沟通：以友好、理性的态度与侵权人进行沟通，说明侵权行为的违法性和危害性，以及你因此遭受的损失。尝试通过协商达成和解协议，解决纠纷。

3. 寻求行政调解或查处

   • 向农业部门投诉：如果协商无果，可以向当地的农业行政主管部门投诉，请求其对侵权行为进行调查和处理。农业部门有权对侵权行为进行查处，包括责令停止侵权行为、没收违法所得、罚款等。
   • 申请行政调解：在投诉的同时，可以申请农业部门进行行政调解。行政调解是一种快速、便捷的解决纠纷方式，由农业部门组织双方进行协商，促成双方达成调解协议。

4. 提起民事诉讼

   • 准备诉讼材料：如果行政调解无果或侵权人拒绝履行调解协议，可以向人民法院提起民事诉讼。在起诉前，需要准备好起诉状、证据材料等诉讼文件。
   • 明确诉讼请求：在起诉状中，明确自己的诉讼请求，如要求侵权人停止侵权行为、赔偿经济损失（包括直接损失和间接损失）、支付合理维权费用等。
   • 参与诉讼过程：在诉讼过程中，积极参与庭审活动，提供证据证明自己的主张，反驳对方的抗辩理由。最终，由法院根据事实和法律规定作出判决。

5. 考虑刑事报案（如构成犯罪）

   • 判断是否构成犯罪：如果侵权行为情节严重，如销售金额巨大、造成严重后果等，可能构成犯罪。此时，可以考虑向公安机关报案，请求其对侵权人进行刑事立案侦查。
   • 配合刑事调查：在刑事报案后，积极配合公安机关的调查工作，提供证据材料，协助公安机关查明事实真相。

在处理制种玉米侵权问题时，需要注意以下几点：

• 及时行动：一旦发现侵权行为，应尽快采取行动，防止侵权行为继续扩大和损失进一步增加。
• 保留证据：在整个处理过程中，要妥善保留所有相关证据，以备不时之需。
• 理性维权：在维权过程中，要保持理性、冷静的态度，避免采取过激行为或违法手段。

如果你在处理制种玉米侵权问题时遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和帮助。