结论：擅自设置招牌只罚款而未改正，一般不能直接结案，需要视具体情况判断后续处理方式。以下是详细分析：

1. 行政处罚的完整程序要求
   根据《行政处罚法》及《城市市容和环境卫生管理条例》等相关规定，行政机关对擅自设置招牌的违法行为，通常需遵循“责令改正+罚款”的组合处罚程序。若仅罚款而未要求限期改正，或当事人未在期限内完成整改，行政机关应继续履行法定职责，包括但不限于：

   • 再次责令改正：明确要求当事人拆除违规招牌或办理合法手续；
     
   • 采取强制措施：如当事人拒不改正，行政机关可依法强制拆除，费用由当事人承担；
     
   • 加重处罚：部分地方性法规规定，逾期未改正的，可按日连续处罚或提高罚款额度。
     结案条件：需以违法行为彻底消除（如招牌拆除或合法化）为前提，仅罚款未改正不符合结案标准。

2. 地方性法规的特殊规定
   部分城市对招牌设置管理有更严格的地方性法规，例如：

   • 上海：《上海市户外招牌设置管理办法》明确要求，违规设置招牌的，需先限期改正，逾期未改正的方可处罚；
     
   • 北京：《北京市市容环境卫生条例》规定，行政机关可先责令改正，拒不改正的再罚款并强制拆除。
     若地方性法规明确要求“改正为处罚前提”，则未改正前不得直接结案，需补充整改程序。

3. 行政诉讼风险
   若行政机关仅罚款未督促改正，当事人可能以“行政处罚未履行法定程序”为由提起行政诉讼，法院可能判决：

   • 撤销原处罚决定，要求行政机关重新作出包含“责令改正”的完整处罚；
     
   • 确认行政机关未履行法定职责违法，责令其限期整改。
     因此，未改正直接结案可能引发程序违法风险，行政机关通常不会主动采取此方式。

4. 实务中的变通处理
   极少数情况下，若当事人因客观原因（如疫情、自然灾害）无法立即改正，但已提交整改计划并承诺期限，行政机关可能暂缓结案，但需满足：

   • 当事人书面承诺整改期限；
     
   • 行政机关备案并定期核查；
     
   • 逾期未整改的立即恢复处罚程序。
     此情形需严格依法定条件操作，非普遍适用。

建议：

• 若您是当事人，收到罚款通知后应立即整改，避免后续强制措施或更高处罚；
  
• 若您是行政机关工作人员，需确保处罚程序完整，避免因程序瑕疵引发诉讼；
  
• 如有争议，可提供具体城市及处罚文书内容，我可进一步分析地方性法规的适用性。