结论前置：
- 若案件尚未立案，且诈骗金额5000元已达到多数地区的刑事立案标准，即使已退还2500元，公安机关仍可能立案。
- 若案件已作为治安案件处理，或当地立案标准高于5000元，则可能不会刑事立案，但诈骗行为仍可能受到治安处罚。
详细分析：
一、刑事立案的可能性
诈骗金额与立案标准：
- 根据《最高人民法院、最高人民检察院关于办理诈骗刑事案件具体应用法律若干问题的解释》，诈骗公私财物价值三千元至一万元以上的，通常认定为“数额较大”，是刑事立案的起点。因此，诈骗5000元在多数地区已达到刑事立案标准。
- 即便已退还2500元，剩余的2500元加上已退还的部分，仍构成诈骗5000元的事实，不影响刑事立案的判定。
特殊情形的考虑：
- 如果诈骗行为涉及特殊情形，如通过发送短信、拨打电话或利用互联网等发布虚假信息对不特定多数人实施诈骗，或诈骗救灾、抢险等特定款物，或造成被害人自杀、精神失常等严重后果，即使诈骗数额接近但未完全达到“数额较大”标准，也可能被追究刑事责任。不过，在您描述的情况下，这些特殊情形似乎并不适用。
地区差异：
- 不同省、自治区、直辖市可能会根据当地的经济社会发展情况和治安形势，对诈骗罪的立案标准做出具体规定。因此，在某些地区，立案标准可能略有差异。但诈骗5000元在多数地区已达到立案标准，所以这一差异通常不会影响立案决定。
二、治安案件立案的可能性
未达到刑事立案标准时的处理：
- 如果诈骗金额未达到当地的刑事立案标准，或者案件已被作为治安案件处理，公安机关将依据《中华人民共和国治安管理处罚法》第四十九条的规定，对诈骗者处以拘留、罚款等行政处罚。
已退还金额的影响：
- 已退还的2500元可能会作为诈骗者认罪态度或悔罪表现的考量因素，在治安处罚时予以从轻或减轻处罚。但这并不影响对诈骗行为的定性，即仍构成诈骗。
三、报案与法律建议
及时报案：
- 无论诈骗金额多少，一旦发现自己遭受诈骗，都应立即向当地公安机关报案。报案时，应提供尽可能详细的证据和线索，如聊天记录、转账记录、对方联系方式等，以协助警方侦破案件。
了解当地规定：
- 由于不同地方对于诈骗案件的立案标准可能有所不同，建议在报案前咨询当地公安机关或了解具体的法律规定和立案标准。这有助于您更准确地判断案件的处理方式和可能的结果。
积极配合调查：
- 在案件侦查过程中，您应积极配合公安机关的工作，提供必要的协助和支持。这有助于加快案件的侦破进度，提高追回损失的可能性。
法律后果的认知：
- 如果案件被刑事立案，诈骗者可能面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役或罚金等。如果案件被作为治安案件处理，诈骗者则可能面临行政处罚，如拘留或罚款等。无论哪种情况，诈骗行为都将受到法律的制裁。
总结与提醒：
诈骗5000元在多数地区已达到刑事立案标准，即使已退还2500元，公安机关仍可能立案。如果案件被作为治安案件处理或当地立案标准高于5000元，则可能不会刑事立案，但诈骗行为仍可能受到治安处罚。因此，我建议您一旦发现自己遭受诈骗，应立即向当地公安机关报案，并积极配合调查工作。同时，也提醒您提高防范意识，避免上当受骗。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。