要签订一份确认不是挂靠设计院的协议，关键在于明确双方的合作模式、责任划分、权益归属以及保密和违约责任等核心条款，以确保合作是基于真实的技术服务或项目合作，而非简单的资质挂靠。以下是一个基于技术服务合同框架的详细建议，供您参考：

一、协议标题与引言

• 标题：明确为“技术服务合作协议”或“项目合作协议”，以体现双方是基于真实项目或技术服务进行合作。
• 引言：简述双方合作的背景、目的和原则，强调合作是基于各自的专业能力和资源互补，而非资质挂靠。

二、合作双方信息

• 详细列出合作双方的名称、地址、法定代表人或授权代表信息，以及联系方式等，确保协议主体的明确性。

三、合作内容与范围

• 技术服务目标：明确合作的具体目标，如完成某个设计项目、提供技术咨询等。
• 技术服务内容：详细描述双方各自承担的具体工作内容，包括设计、咨询、审核等环节，确保无资质挂靠的嫌疑。
• 技术服务方式：说明合作的具体方式，如现场工作、远程协作、定期会议等。

四、合作期限与进度

• 明确合作的起始和结束日期，以及关键节点的进度要求，确保合作的有序进行。

五、双方责任与义务

• 甲方（委托方）责任：包括提供必要的技术资料、工作条件、协作事项等，以及按时支付技术服务费用。
• 乙方（受托方/设计院）责任：强调乙方应以其自身的技术力量和资源完成合作内容，不得将资质或名义出借给甲方或其他第三方使用。同时，乙方应确保提供的技术服务符合相关标准和规范。

六、权益归属与保密条款

• 权益归属：明确合作过程中产生的技术成果、知识产权等权益的归属，避免后续纠纷。
• 保密条款：双方应约定对合作过程中涉及的商业秘密、技术秘密等保密信息承担保密义务，防止信息泄露。

七、违约责任与争议解决

• 违约责任：详细列出双方违反协议约定时应承担的责任，包括支付违约金、赔偿损失等。
• 争议解决：约定双方因履行协议发生争议时的解决方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等。

八、其他条款

• 包括协议的变更、解除、终止条件，以及通知与送达、适用法律等条款，确保协议的完整性和可操作性。

九、签字盖章与生效

• 协议应由双方法定代表人或授权代表签字并盖章，注明协议的生效日期和份数，确保协议的法律效力。

示例条款（针对避免挂靠嫌疑）：

“乙方承诺，本协议项下的所有技术服务工作均由乙方自行完成，不得将乙方的资质、名义或业务出借、转让给甲方或其他任何第三方使用。乙方应确保其提供的技术服务符合相关法律法规和行业标准的要求，并承担由此产生的全部责任。”

通过以上条款的设置，可以明确双方的合作模式和责任划分，有效避免挂靠设计院的嫌疑。在签订协议前，建议双方充分沟通、协商，确保协议内容符合双方的实际情况和需求。如有必要，可咨询专业律师或法律顾问的意见。