关于设计院挂靠协议是否有效的问题，这实际上涉及到了挂靠行为的法律认定和合同效力的问题，需要从多个角度进行综合分析。

首先，我们需要明确的是，挂靠行为在当前的法律环境下并没有一个明确的定义，其法律认定和责任承担散见于各个单行法律法规和司法解释中。因此，对于挂靠协议的效力，不能一概而论，而需要根据具体情况进行具体分析。

从劳动关系的角度来看，如果挂靠协议仅仅涉及证书的注册和使用，而并未建立实际的用工关系，即挂靠者并未在挂靠单位从事有报酬的劳动，也未接受挂靠单位的日常管理，那么这种挂靠协议通常不会被认定为构成劳动关系。在这种情况下，挂靠协议可能更多地被视为一种资质借用或劳务合作的协议，其效力取决于协议的具体内容和双方的约定。

然而，如果挂靠协议中涉及到了施工合同的挂靠，即挂靠者借用挂靠单位的资质进行施工活动，那么问题就变得更为复杂。在这种情况下，挂靠施工合同的效力往往取决于法律所追寻的社会效果以及如何保障各方当事人的合法权益。一些观点认为，认定挂靠施工合同有效可以更好地牵制被挂靠一方，避免其轻易逃脱法律责任，同时也更符合相关司法解释中关于让挂靠双方对工程质量问题承担连带责任的规定。而另一些观点则可能基于严肃管理秩序的考虑，认为挂靠行为违反了相关法律法规，因此挂靠施工合同应被认定为无效。

在实际操作中，对于挂靠协议的效力认定，往往需要综合考虑多个因素，包括协议的具体内容、双方的约定、挂靠行为的性质以及可能产生的法律后果等。如果挂靠协议违反了法律法规的强制性规定，或者损害了国家、集体或第三人的利益，那么这种协议很可能会被认定为无效。

因此，我无法直接给出一个关于设计院挂靠协议是否有效的明确答案。这需要根据具体的协议内容、挂靠行为的性质以及相关法律法规的规定来进行综合判断。如果您面临这样的问题，我建议您咨询专业的法律人士，以便得到更准确、更具体的法律建议。