结论：单位电梯被水淹，电梯公司是否需要赔偿以及是否合法，不能一概而论，需根据具体情况判断，包括水淹原因、电梯公司是否存在过错等。以下从不同角度进行分析：
一、若水淹是由于电梯公司自身原因导致
法律责任分析：
- 根据《中华人民共和国民法典》中关于侵权责任的相关规定，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。如果电梯公司因维护不当、管理疏忽等自身过错导致电梯水淹，给单位造成损失，那么电梯公司应当承担赔偿责任。
- 例如，电梯公司未按照规定对电梯进行定期检查和维护，导致电梯部件老化、损坏，进而引发水淹事故，这种情况下电梯公司显然存在过错，需要赔偿。
合法性判断：
- 电梯公司承担赔偿责任是基于其过错行为，这是符合法律规定的。单位有权要求电梯公司对其因水淹造成的损失进行赔偿，这是合法的维权行为。
二、若水淹是由于不可抗力或第三方原因导致
法律责任分析：
- 如果水淹是由于不可抗力（如自然灾害、极端天气等）或第三方原因（如其他单位施工导致水管破裂等）造成的，且电梯公司没有过错，那么电梯公司通常不需要承担赔偿责任。
- 例如，因暴雨导致电梯井进水，且电梯公司已经采取了合理的防范措施，这种情况下电梯公司无需赔偿。
合法性判断：
- 在这种情况下，电梯公司不承担赔偿责任是合法的。单位不能无理要求电梯公司承担不属于其责任范围内的损失。
三、若水淹原因不明或存在争议
法律责任分析：
- 如果水淹原因不明或双方对原因存在争议，那么可能需要通过专业鉴定或法律程序来确定责任归属。
- 在这种情况下，单位可以收集相关证据（如现场照片、视频、维修记录等），并咨询专业律师，通过法律途径来维护自己的权益。
合法性判断：
- 通过法律程序来确定责任归属是合法的。在争议无法解决的情况下，诉讼或仲裁是有效的解决方式。
建议与措施
单位方面：
- 在水淹事故发生后，单位应及时采取措施防止损失扩大，并收集相关证据。
- 与电梯公司进行沟通协商，尝试通过友好方式解决争议。
- 如果协商无果，可以咨询专业律师并考虑通过法律途径来维护自己的权益。
电梯公司方面：
- 电梯公司应积极配合单位进行事故调查和处理工作。
- 如果认为自己没有过错，应提供相关证据来支持自己的观点。
- 在争议无法解决的情况下，也应尊重法律程序并积极参与诉讼或仲裁。
总结：单位电梯被水淹后，电梯公司是否需要赔偿以及是否合法，需根据具体情况来判断。如果电梯公司存在过错，则需要承担赔偿责任；如果电梯公司没有过错或水淹是由于不可抗力或第三方原因造成的，则电梯公司通常不需要承担赔偿责任。在争议无法解决的情况下，双方可以通过法律途径来维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。