结论：公司使用私户发工资的合法性需根据具体情况判断，若企业基于合理原因并依法依规操作，则不违法；但若存在逃避税务监管、社保缴纳等违法行为，则属于违法。以下是对此问题的详细分析：
一、合法情形
依法代扣代缴个税：
- 企业使用私户发工资时，必须按照个人所得税法的规定，准确计算员工应缴纳的个人所得税，并履行代扣代缴义务。这要求企业每月根据员工的工资收入、扣除项目等计算出应纳税额，并从工资中扣除后按时向税务机关申报缴纳。若企业能确保这一点，则使用私户发工资在税务层面是合法的。
工资如实入账：
- 企业需将通过私户发放的工资如实记录在财务账目中，遵循相关的会计准则和财务制度。这包括在会计凭证中详细记录每一笔私户发放工资的情况，如发放时间、金额、员工姓名等，以确保财务信息的真实性和透明度。若企业能做到这一点，则使用私户发工资在财务层面也是合法的。
不存在逃避监管目的：
- 使用私户发工资不是为了逃避税务监管、社保缴纳或其他法定义务。例如，因公户临时冻结等特殊原因，经与员工协商一致后，短期内使用私户发放工资，且后续及时恢复公户发放，并正常履行各项义务，这种情况通常是被允许的。
签订正式劳动合同：
- 企业与员工之间必须签订正式的劳动合同，并按照合同约定支付工资。这是确保双方权益的基础，也是使用私户发工资合法性的前提之一。
保留支付记录和凭证：
- 企业以私人账户发放工资时，必须保留相关的支付记录和凭证，以备相关部门进行核查。这是证明企业合法支付工资的重要依据。
二、违法情形
逃避缴纳税款：
- 企业通过私户发工资故意隐瞒员工的真实工资收入，降低计税依据，从而少缴纳个人所得税和企业所得税。这种行为违反了税收法律法规，税务机关有权依法追缴税款，并对企业处以罚款、加收滞纳金等处罚。
规避社保缴费：
- 企业为了降低社保成本，通过私户发放部分工资，使社保缴费基数降低。这种行为侵害了员工的社保权益，劳动监察部门可以责令企业限期改正，补缴社保费用，并可能对企业进行罚款。
侵害员工权益：
- 使用私户发工资可能导致员工的工资收入缺乏有效的证据证明，在发生劳动纠纷时，员工难以维护自己的合法权益。此外，如果企业不按照劳动合同约定的时间和金额支付工资，也违反了《劳动合同法》的相关规定，员工可以要求企业承担相应的法律责任。
违反金融管理规定：
- 企业资金与个人账户混用，可能违反《人民币银行结算账户管理办法》等相关金融管理规定。银行及金融监管机构可能对此类异常交易进行调查与处罚。
三、建议与指导
遵守法律法规：
- 企业在支付员工工资时，应严格遵守相关的法律法规和税务规定，确保合法合规。使用私户发工资应谨慎操作，并确保符合上述合法情形的条件。
维护员工权益：
- 企业应尊重并维护员工的合法权益，包括签订正式劳动合同、按时足额支付工资、依法缴纳社保等。这是企业社会责任的体现，也是避免法律纠纷的关键。
建立健全财务管理制度：
- 企业应建立健全的财务管理制度，确保工资的合法发放与税务的准确申报。这有助于提升企业的信誉与融资能力，也有助于维护企业的长远发展。
总结：公司使用私户发工资的合法性取决于企业的具体操作是否符合相关法律法规和税务规定。企业应确保自身行为的合法合规性，以维护企业和员工的共同利益。若您对此有任何疑问或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询。