结论：公司用法人私户发工资是否违法，需根据具体情况判断。若企业基于合理原因并依法依规操作，则不违法；若存在逃避税务监管、社保缴纳等违法行为，则属于违法。
一、合法情形
依法代扣代缴个税：
- 无论通过公户还是私户发放工资，企业必须按照个人所得税法的规定，准确计算员工（包括法人，如果其与公司存在劳动关系）应缴纳的个人所得税，并履行代扣代缴义务。这要求企业每月根据员工的工资收入、扣除项目等计算出应纳税额，并从工资中扣除后按时向税务机关申报缴纳。
工资如实入账：
- 企业需将通过私户发放的工资如实记录在财务账目中，遵循相关的会计准则和财务制度。这包括在会计凭证中详细记录每一笔私户发放工资的情况，如发放时间、金额、员工姓名等，以确保财务信息的真实性和透明度。
不存在逃避监管目的：
- 使用私户发工资不是为了逃避税务监管、社保缴纳或其他法定义务。例如，因公户临时冻结等特殊原因，经与员工协商一致后，短期内使用私户发放工资，且后续及时恢复公户发放，并正常履行各项义务，这种情况通常是被允许的。
签订正式劳动合同：
- 如果法人与公司之间存在劳动关系，企业与法人之间必须签订正式的劳动合同，并按照合同约定支付工资。这是确保双方权益的基础。
保留支付记录和凭证：
- 企业以私人账户发放工资时，必须保留相关的支付记录和凭证，以备相关部门进行核查。
二、违法情形
逃避缴纳税款：
- 通过私户发工资故意隐瞒员工的真实工资收入，降低计税依据，从而少缴纳个人所得税和企业所得税。这种行为违反了税收法律法规，税务机关有权依法追缴税款，并对企业处以罚款、加收滞纳金等处罚。
规避社保缴费：
- 企业为了降低社保成本，通过私户发放部分工资，使社保缴费基数降低。这种行为侵害了员工的社保权益，劳动监察部门可以责令企业限期改正，补缴社保费用，并可能对企业进行罚款。
侵害员工权益：
- 使用私户发工资可能导致员工的工资收入缺乏有效的证据证明，在发生劳动纠纷时，员工难以维护自己的合法权益。此外，如果企业不按照劳动合同约定的时间和金额支付工资，也违反了《劳动合同法》的相关规定，员工可以要求企业承担相应的法律责任。对于法人而言，如果其与公司存在劳动关系，同样享有这些权益。
违反公司治理结构：
- 如果法人未经合法程序擅自通过私户给自己发放工资，可能构成违法行为，如抽逃出资、逃避税收等。这些行为严重损害了公司财务的完整性和税收的公平性。
三、建议与指导
遵守法律法规：
- 企业在支付员工（包括法人）工资时，应严格遵守相关的法律法规和税务规定，确保合法合规。
维护员工权益：
- 企业应尊重并维护员工的合法权益，包括签订正式劳动合同、按时足额支付工资、依法缴纳社保等。对于法人而言，如果其与公司存在劳动关系，同样应享受这些权益。
加强内部管理：
- 企业应建立健全的财务管理制度，确保工资发放的合法性和合规性。同时，应加强对私户使用的监管，防止出现违法行为。
及时咨询与应对：
- 如果企业对工资发放方式存在疑问或面临相关纠纷，应及时向我咨询，以便及时解决问题并降低法律风险。
综上所述，公司用法人私户发工资的合法性取决于企业的具体操作是否符合相关法律法规和税务规定。企业应确保自身行为的合法合规性，以维护企业和员工的共同利益。