在处理一级甲等医疗事故（即造成患者死亡的医疗事故）中，当医疗机构承担次要责任时，其赔付标准并非固定不变，而是需要依据《医疗事故处理条例》等相关法律法规，并综合考虑多种因素来确定。以下是对这一问题的详细解答：

一、赔偿项目及计算标准

1. 医疗费：

   • 计算依据：因医疗事故导致的人身损害所发生的医疗费用，凭据支付，不包括原发病医疗费用。若结案后仍需继续治疗，则按基本医疗费用支付。

2. 误工费：

   • 有固定收入的患者：按误工减少的固定收入计算；若收入高于当地上一年度职工年平均工资3倍，则按3倍计算。
   • 无固定收入的患者：按当地上一年度职工年平均工资计算。

3. 住院伙食补助费：

   • 按医疗事故发生地国家机关一般工作人员的出差伙食补助标准计算。

4. 陪护费：

   • 患者住院期间需要专人陪护的，按当地上一年度职工年平均工资计算陪护费用。

5. 丧葬费：

   • 按医疗事故发生地所规定的丧葬费补助标准计算，通常为受诉法院所在地上一年度职工月平均工资标准的六个月总额。

6. 交通费：

   • 按患者实际必需的交通费用计算，凭据支付。

7. 住宿费：

   • 按医疗事故发生地国家机关一般工作人员的出差住宿补助标准计算，凭据支付。

8. 精神损害抚慰金：

   • 造成患者死亡的，按医疗事故发生地居民年平均生活费计算，赔偿年限最长不超过6年。

二、次要责任的确定与赔偿比例

• 次要责任定义：指医疗事故损害后果主要由其他因素造成，医疗过失行为起次要作用。
• 赔偿比例：次要责任的具体赔付比例并非固定，而是根据患者的具体情况、医疗机构的过错程度、损害后果的严重程度等多种因素综合判定。在司法实践中，次要责任通常承担的赔偿比例在20%-40%左右，但具体比例需由法院或相关机构根据案件实际情况进行裁量。

三、最终赔偿金额的计算

最终赔偿金额是将上述各项赔偿项目的总额乘以次要责任对应的赔偿比例得出。例如，若经计算各项赔偿项目总和为100万元，法院判定医疗机构承担30%的次要责任，则医疗机构最终需赔付的金额为100万 × 30% = 30万元。

四、实际操作建议

• 在处理一级甲等医疗事故次要责任的赔付问题时，应充分考虑各种相关因素，并参考当地的法律法规和相关政策。
• 由于每个具体的医疗事故案件都有其独特性，赔偿金额需根据具体情况进行计算，并可能受到当地法律、法规和政策的影响。因此，建议寻求专业法律人士的帮助，以确保权益得到妥善维护，并确保赔偿过程的合法性和公正性。

综上所述，一级甲等医疗事故次要责任的赔付标准是一个复杂而细致的过程，需要综合考虑多个方面的因素和法律规定。通过明确赔偿项目和计算标准，以及合理确定赔付比例，可以确保赔偿的公正性和合理性。