关于您提出的“租赁合同按服务费开票是否合法”的问题，这确实是一个涉及合同法和税务法规的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、合同约定的合法性基础
首先，从合同法的角度来看，双方当事人在平等、自愿的基础上达成的约定，只要不违反法律法规的强制性规定和公序良俗，通常具有法律效力。因此，如果租赁合同中明确约定了按服务费开票，并且这一约定是双方真实意思的表示，那么从合同法的角度，这一约定是有效的。
二、税务法规的考量
然而，我们还需要考虑税务法规对这一问题的规定。
纳税义务主体：
- 根据税收法律法规，房屋出租方通常是法定的纳税义务人，负责缴纳与房屋租赁相关的税费。这意味着，即使合同中约定了由承租方承担税费，出租方仍然是法定的纳税义务人，需要履行相关的纳税义务。
发票开具：
- 发票应当由销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的收款方（即出租方）开具。这是发票管理的基本规定。
- 如果合同中约定按服务费开票，实际上是在改变发票的开具内容。这种情况下，必须确保这种改变是合法的，并且符合税务机关的规定。例如，如果租赁服务中确实包含了某些服务费用，且这些费用可以单独开具服务费发票，那么这种约定可能是合法的。但如果只是为了规避税收或进行其他不合法目的而约定按服务费开票，那么这种约定就是违法的。
三、实际操作与注意事项
明确约定内容：
- 双方在签订租赁合同时，应明确约定开票的具体内容、方式以及税费的承担方。这有助于避免后续产生纠纷。
合法操作：
- 无论约定如何，双方都必须确保税费缴纳的合法性和及时性。出租方作为法定的纳税义务人，不能因为合同中的约定而逃避纳税责任。
- 如果确实需要按服务费开票，双方应咨询税务机关或专业律师的意见，确保这种操作是合法的，并且符合税务机关的规定。
避免违法风险：
- 双方应避免通过约定按服务费开票来规避税收或进行其他不合法目的。这种行为不仅可能面临税务机关的处罚，还可能损害双方的商业信誉和合作关系。
四、结论
综上所述，租赁合同按服务费开票是否合法，取决于具体的约定内容、税务法规的规定以及实际操作中的合法性。如果双方确实需要在合同中约定按服务费开票，应确保这种约定是合法的、真实的，并且符合税务机关的规定。同时，双方也应咨询专业律师或税务机关的意见，以降低违法风险并保障自身的合法权益。