结论：招标的工程合同签订后履行过程中发包人主体变更，并不直接违反《招标投标法》，但需满足一定条件并遵循相关法律规定，否则可能引发一系列法律问题。
分析说明：
发包人主体变更的合法性：
- 一般原则：在合同履行过程中，发包人主体变更（如公司合并、分立、股权转让等）本身并不直接违反《招标投标法》。关键在于变更是否遵循了相关法律法规，特别是关于合同转让和招标投标程序的规定。
- 合同转让规定：根据《民法典》等相关法律，合同一方将合同权利义务全部或部分转让给第三人的，应当取得合同另一方的同意，并依法办理相关手续。在建设工程合同中，发包人主体变更通常涉及合同权利义务的转让，因此需取得承包人的同意，并可能需办理相关审批或备案手续。
招标投标程序的遵循：
- 招标投标法的目的：《招标投标法》旨在规范招标投标活动，保护国家利益、社会公共利益和招标投标活动当事人的合法权益，提高经济效益，保证项目质量。因此，发包人主体变更不应损害这些利益。
- 变更后的程序要求：如果发包人主体变更导致原招标投标活动的实质性条件发生变化（如发包人资质、资金状况等），可能需要重新进行招标或履行相关审批程序，以确保变更后的发包人仍具备履行合同的能力和条件。
可能引发的法律问题：
- 合同效力问题：如果发包人主体变更未遵循相关法律法规或合同约定，可能导致变更无效或合同部分无效，进而影响合同的履行和双方的权利义务。
- 违约责任：如果发包人主体变更导致合同无法履行或履行不符合约定，发包人可能需承担违约责任，包括赔偿承包人因此遭受的损失。
- 行政处罚：如果发包人主体变更违反了《招标投标法》或其他相关法律法规的规定，可能面临行政处罚，如罚款、责令改正等。
法律建议：
- 谨慎处理变更事宜：发包人在考虑主体变更时，应谨慎评估变更的合法性和可行性，确保变更不会损害国家利益、社会公共利益和承包人的合法权益。
- 遵循法定程序：发包人应依法办理相关审批或备案手续，确保变更的合法性和有效性。如果变更涉及合同权利义务的转让，应取得承包人的同意并签订书面转让协议。
- 及时沟通协商：发包人应与承包人及时沟通协商变更事宜，就变更后的合同履行、权利义务等达成一致意见，并签订补充协议或修改原合同条款。
- 寻求专业法律帮助：在处理发包人主体变更事宜时，发包人可以寻求专业律师的法律帮助，以确保变更的合法性和合规性，并降低法律风险。
后续行动依据：
- 如果发包人主体变更已经发生或即将发生，发包人应立即评估变更的合法性和可行性，并采取相应的法律措施。
- 如果承包人对发包人主体变更提出异议或要求赔偿损失，发包人应积极与承包人沟通协商，寻求妥善解决方案。
- 如果发包人主体变更涉及行政处罚或法律诉讼等法律风险，发包人应及时寻求专业律师的法律帮助，以维护自身合法权益。