在行政复议过程中，如果发现违法线索，行政复议机关会依据《中华人民共和国行政复议法》等相关法律法规，采取一系列精准且有效的处理措施，以确保行政执法的合法性和正当性，同时保护当事人的合法权益。以下是对这一问题的详细解答：
一、针对行政执法行为违法或不当的处理
决定撤销：
- 当行政行为存在主要事实不清、证据不足、适用依据错误、违反法定程序、超越或滥用职权，或具体行政行为明显不当等情形时，行政复议机关可以决定撤销该行政行为。撤销后，原行政行为自始无效，行政机关需重新作出合法的行政行为。
决定变更：
- 若原行政行为部分违法或不当，但直接撤销可能给公共利益或当事人造成重大损失，或原行政行为仅部分适当需要调整时，行政复议机关可以直接对原行政行为的内容进行改变，使其符合法律、法规规定。
确认违法：
- 对于已经实施且无法撤销，或撤销已无实际意义的行政行为，以及某些不适宜直接撤销或变更的具体行政行为，行政复议机关可以确认其违法。这虽然不改变原行政行为的法律效力，但可作为当事人寻求赔偿或其他救济途径的依据。
二、责令重新作出具体行政行为
- 当行政复议机关决定撤销或确认具体行政行为违法，并认为有必要由被申请人重新作出具体行政行为时，会责令被申请人在一定期限内重新作出。此时，被申请人在重新作出具体行政行为时，不得以同一事实和理由作出与原行政行为相同或基本相同的行为（因违反法定程序被撤销的除外），并应严格依法进行认定事实和适用法律。
三、责令履行与赔偿
责令履行：
- 若行政机关未依法履行其职责，行政复议机关会责令其在一定期限内履行法定职责。这适用于行政机关拒绝履行或拖延履行其法定职责的情况。
责令赔偿：
- 当申请人在申请行政复议时一并提出行政赔偿请求，或行政复议机关在审查过程中发现具体行政行为违法且造成申请人合法权益损害时，行政复议机关会决定由被申请人依法给予赔偿。即使申请人最初未提及赔偿事宜，复议机关在发现损害后也可责令被申请人进行赔偿。
四、针对行政复议程序违法的处理
- 如果申请人在行政复议过程中认为复议机关的程序存在违法，如未按时送达文书、未给予充分陈述和申辩机会等，可以向复议机关提出纠正请求。复议机关应遵循合法、公正、公开、及时、便民原则，对违反这些原则的行为进行改正。
- 若复议机关拒绝纠正违法程序，或申请人认为程序违法严重影响复议结果公正性时，可以向上级行政机关或监督部门投诉、举报。上级行政机关或监督部门会责令复议机关改正或依法处理。
- 在极端情况下，如果行政复议程序违法对申请人权益产生实际影响，且其他途径无法有效解决时，申请人还可以向人民法院提起行政诉讼，要求撤销违法的复议决定，并要求复议机关重新作出复议决定。
五、法律责任与处分
- 对于行政复议机关及其工作人员在行政复议活动中的违法行为，如徇私舞弊、渎职失职等，相关法律法规明确了相应的法律责任和处分措施，包括警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等处分，甚至可能追究刑事责任。
综上所述，行政复议机关在发现违法线索时，会依据相关法律法规采取一系列精准且有效的处理措施，以确保行政执法的合法性和正当性，同时保护当事人的合法权益。