在上下游合同中存在背靠背付款条款的情况下，仍然可以起诉。以下是对此问题的详细分析：
一、背靠背付款条款的法律性质
背靠背付款条款，通常指的是在合同中约定，付款方的付款义务取决于其从第三方（如上游供应商或下游客户）处收到款项的情况。这种条款在商业合同中较为常见，特别是在涉及多方交易或供应链金融的场合。从法律性质上看，背靠背付款条款属于合同中的附条件条款，即付款义务的履行以特定条件（第三方付款）的成就为前提。
二、起诉的可行性
合同有效性：
- 首先，需要确认包含背靠背付款条款的合同是否有效。根据《民法典》的相关规定，合同只要双方意思表示真实，不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，即具有法律效力。因此，如果背靠背付款条款是双方真实意思的表示，且不违反上述规定，那么该条款是有效的。
条件成就与否：
- 背靠背付款条款的有效性并不意味着付款方可以无限期地拖延付款。如果第三方已经付款，或者付款方无法证明第三方未付款是由于非自身原因导致的，那么付款方就不能以背靠背付款条款为由拒绝付款。此时，收款方有权依据合同起诉付款方，要求其履行付款义务。
公平原则与诚实信用原则：
- 法院在审理涉及背靠背付款条款的案件时，还会考虑公平原则和诚实信用原则。如果付款方利用背靠背付款条款恶意拖延付款，或者收款方因付款方的拖延而遭受了重大损失，法院可能会根据这些原则对合同条款进行解释或调整，以保护收款方的合法权益。
三、起诉时的注意事项
收集证据：
- 收款方在起诉前应收集充分的证据，证明其已经履行了合同义务，且付款方未按照合同约定付款。这包括合同文本、交货凭证、发票、付款记录等。
明确诉讼请求：
- 收款方在起诉时应明确诉讼请求，包括要求付款方支付的金额、利息、违约金等。同时，还应说明付款方未付款的具体原因和依据。
考虑诉讼风险：
- 虽然起诉是收款方维护自身权益的一种方式，但也需要考虑诉讼风险。如果付款方确实存在合理的抗辩理由（如第三方未付款且非付款方原因导致），那么收款方可能会面临败诉的风险。因此，在起诉前应进行充分的评估和准备。
四、实际操作建议
- 协商与调解：在起诉前，双方可以尝试通过协商或调解的方式解决纠纷。这不仅可以节省诉讼成本和时间，还可以维护双方的商业关系。
- 法律咨询：在涉及复杂法律问题时，建议收款方咨询专业律师的意见。律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议和解决方案。
综上所述，即使上下游合同中存在背靠背付款条款，收款方仍然有权起诉付款方要求其履行付款义务。但需要注意的是，起诉前应收集充分的证据并明确诉讼请求，同时考虑诉讼风险并尝试通过协商或调解解决纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。