在非法经营案件中，若获利用于赔偿第三方，该部分金额仍会被计入违法所得，但在量刑和罚金处罚时可能会作为从轻情节考虑。以下是对此问题的详细分析：

一、违法所得的计算

在非法经营案件中，违法所得是指行为人通过非法经营活动所获得的全部收入，扣除直接用于经营活动的合理支出后的余额。这里的“合理支出”通常指的是与非法经营活动直接相关的成本，如原材料采购、运输费用等，并不包括用于赔偿第三方的款项。因此，即使非法经营获利用于赔偿了第三方，该部分金额在计算违法所得时仍需被计入。

二、赔偿第三方款项的法律性质

赔偿第三方款项是行为人对其非法经营活动所造成的损害进行的一种民事赔偿。这种赔偿行为虽然体现了行为人的一定悔过态度，但并不能改变其非法经营行为的违法性。因此，赔偿第三方款项不能作为免除或减轻刑事责任的理由。然而，在量刑时，法院可能会将这一情节作为从轻或减轻处罚的考虑因素之一。

三、量刑和罚金处罚的考虑因素

在非法经营案件中，法院在量刑和决定罚金数额时，会综合考虑多种因素，包括但不限于：

1. 违法所得的数额：违法所得数额越大，通常意味着行为人的非法经营活动规模越大，社会危害性也越大，因此量刑和罚金处罚也会相应加重。
2. 赔偿情况：如果行为人能够积极赔偿第三方损失，表现出一定的悔过态度，法院可能会在量刑时予以从轻或减轻处罚。但需要注意的是，这种从轻或减轻处罚的幅度是有限的，且必须建立在行为人认罪认罚、积极退赃等基础上。
3. 其他情节：如行为人的主观恶性、是否具有自首、立功等情节，也会对量刑和罚金处罚产生影响。

四、实际操作中的建议

1. 如实供述：在面临非法经营指控时，行为人应如实供述自己的违法所得情况，包括是否用于赔偿第三方等。隐瞒或虚报违法所得数额可能会加重处罚。
2. 积极退赃：如果可能的话，行为人应积极退赃，包括退还非法所得和赔偿第三方损失。这有助于体现行为人的悔过态度，争取从轻或减轻处罚。
3. 寻求法律帮助：非法经营案件涉及复杂的法律问题，行为人应寻求专业律师的帮助，以便更好地维护自己的合法权益。

举例说明：假设某行为人因非法经营被查处，其违法所得为100万元，其中50万元用于赔偿了第三方损失。在计算违法所得时，这100万元仍需全部计入。但在量刑时，法院可能会考虑到行为人已经赔偿了部分损失，表现出一定的悔过态度，从而在量刑上予以从轻或减轻处罚。不过，这种从轻或减轻处罚的幅度是有限的，且必须建立在行为人认罪认罚、积极退赃等基础上。

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