非法经营所得利息的计算需结合具体违法情形与法律规定综合判定，核心原则是“全额认定+违法性排除”，具体分以下两种情况分析：

1. 若非法经营行为本身涉及“利息”性质收益（如非法放贷、非法吸收公众存款）

根据《刑法》及相关司法解释，非法经营所得利息通常按“实际收取的全部利息收入”计算，但需排除合法部分（如已支付的合法本金对应的合理利息）。例如：

• 非法放贷：若行为人以营利为目的，未经许可频繁向不特定人放贷，利息计算以借款人实际支付的利息总额为准（包括“砍头息”“服务费”等变相利息）。根据《关于办理非法放贷刑事案件若干问题的意见》，若年利率超过36%，超出部分可能被认定为违法所得。
  
• 非法吸收公众存款：若行为人通过高息吸引资金，利息计算以吸收资金时承诺支付给集资参与人的全部利息为准，但需扣除已返还的部分（如部分兑付的利息）。
  

关键点：此类利息本质是“违法收益”，计算时需全额追缴，但司法实践中可能根据行为人主观恶性、社会危害性等调整追缴范围（如仅追缴超出合法利率的部分）。

2. 若非法经营行为与“利息”无直接关联（如非法经营证券、期货、保险业务）

此时“利息”可能指行为人通过非法经营获取的“额外收益”（如手续费、佣金、差价等），计算方式为：

• 全额认定：以行为人实际获得的全部非法收入为基数，包括直接收益（如交易手续费）和间接收益（如资金占用产生的利息）。
  
• 扣除成本？：司法实践中一般不扣除经营成本（如场地费、设备费），因非法经营成本本身不受法律保护。例如，非法经营外汇业务中，行为人通过低买高卖赚取差价，差价全额视为违法所得，即使其支付了部分“成本”。
  

例外情形：若行为人能证明部分收益与非法经营无关（如合法投资收益），可申请排除，但需承担举证责任。

总结建议

1. 立即停止非法经营行为：继续实施可能面临刑事处罚（如非法经营罪）及行政处罚（如没收违法所得、罚款）。
   
2. 主动配合调查：若已被立案，如实说明资金流向、收益计算方式，争取从轻处理（如自首、退赃）。
   
3. 咨询专业律师：非法经营案件涉及刑事、行政、民事交叉问题，需结合具体证据（如合同、转账记录）制定辩护策略。
   

若有进一步细节（如具体行业、收益模式），可向我补充说明，我会为你分析更精准的计算方式及法律风险。