结论：旷工一天扣三天工资并不意味着这三天都没有工资，这种做法是否合法需结合具体情况判断。以下从不同角度进行分析：

1. 从劳动合同和规章制度的角度

   • 合法性判断：如果用人单位在劳动合同中明确约定，或者在公司规章制度中明确规定“旷工一天扣三天工资”，并且该劳动合同或规章制度已经经过民主程序制定（如职工代表大会讨论、与工会协商等），且已经向劳动者公示或告知，那么从合同和制度层面来看，这种规定对劳动者是具有约束力的。但这并不意味着这种扣除方式完全合法，因为还需要考虑是否违反了法律法规的强制性规定。
   • 实际操作中的问题：即使劳动合同或规章制度中有这样的规定，如果扣除的工资数额超过了劳动者当月工资的20%，或者扣除后劳动者的工资低于当地最低工资标准，那么这种扣除方式仍然是违法的。因为根据《工资支付暂行规定》第十六条：“因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。”

2. 从法律法规的角度

   • 直接规定：目前并没有直接的法律法规规定旷工一天不能扣三天工资，但是法律法规对工资的扣除有原则性的规定，即扣除工资必须合法、合理，不能侵犯劳动者的合法权益。旷工一天扣三天工资的做法，往往被认为是不合理的，因为它超出了劳动者旷工所造成的实际损失。
   • 劳动者的权益保护：如果用人单位以旷工一天扣三天工资为由，实际扣除了劳动者三天的工资，而劳动者认为这种扣除方式不合法，那么劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，要求用人单位返还被非法扣除的工资。

3. 从实际案例的角度

   • 案例分析：在实际的劳动争议案件中，法院或仲裁机构往往会根据具体情况来判断用人单位扣除工资的行为是否合法。如果用人单位能够证明劳动者旷工给其造成了实际损失，并且扣除的工资数额与实际损失相当，那么这种扣除行为可能会被认定为合法。但是，如果用人单位无法证明实际损失，或者扣除的工资数额明显过高，那么这种扣除行为很可能会被认定为违法。

建议：

• 对劳动者：如果遇到用人单位以旷工一天扣三天工资为由扣除工资的情况，首先要查看自己的劳动合同和公司的规章制度，了解是否有相关的规定。如果认为这种扣除方式不合法，可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
• 对用人单位：在制定劳动合同和规章制度时，应确保相关规定合法、合理，并经过民主程序制定和公示。在扣除劳动者工资时，应确保扣除的数额与劳动者的实际损失相当，并遵守相关法律法规的规定。

示例：假设一个劳动者月工资为6000元，旷工一天，用人单位如果扣除其三天工资即1800元（假设按日工资计算方式为月工资除以当月天数，此处为简化计算直接按三天算），这很可能超过了劳动者旷工所造成的实际损失，也超过了劳动者当月工资的20%（即1200元），因此这种扣除方式是不合法的。

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