法定节假日单位扣员工的出勤工资是不合法的。以下从多个角度为你详细分析：

法律背景

根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：

1. 安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
2. 休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
3. 法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。

从这一条款可以看出，法定节假日是劳动者的休息日，用人单位如果安排劳动者在法定节假日工作，需要支付不低于工资的百分之三百的工资报酬，而不是扣除出勤工资。

实际操作中的情况

1. 如果单位在法定节假日安排了工作：

   • 单位应当按照法律规定支付三倍工资，而不是扣除出勤工资。如果单位扣除了出勤工资，那么劳动者有权要求单位补发工资，并可能依据相关法律法规要求单位支付赔偿金。

2. 如果单位在法定节假日没有安排工作：

   • 劳动者享有休息权，单位应当正常支付工资，不得扣除。如果单位无故扣除了工资，劳动者同样有权要求单位补发工资，并可能依据相关法律法规要求单位支付赔偿金。

法律建议

1. 保留证据：

   • 如果单位在法定节假日扣除了你的出勤工资，你应当保留好相关的工资条、考勤记录等证据，以便在需要时证明单位的行为。

2. 与单位协商：

   • 在发现单位扣除工资后，你可以先与单位进行协商，要求单位补发工资并说明理由。如果单位拒绝补发或理由不充分，你可以考虑采取进一步的法律措施。

3. 寻求法律援助：

   • 如果与单位协商无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助。劳动监察部门有权对单位的违法行为进行调查和处理，并帮助你维护合法权益。

可能的法律后果

如果单位在法定节假日扣除员工的出勤工资，且经劳动监察部门调查属实，单位可能会面临以下法律后果：

1. 补发工资：

   • 单位需要补发被扣除的工资，并可能支付额外的赔偿金。

2. 行政处罚：

   • 劳动监察部门可以对单位进行行政处罚，如罚款、警告等。

3. 声誉损害：

   • 单位的违法行为可能会对其声誉造成损害，影响其在市场上的竞争力。

综上所述，法定节假日单位扣员工的出勤工资是不合法的。如果你遇到了这种情况，应当保留好相关证据，与单位进行协商，并在必要时寻求法律援助。如果你还有其他关于劳动工伤（工资福利）方面的问题，可以直接向我咨询。