在自己耕地上未经批准擅自盖房是违法的，但在特定条件下，经过法定审批程序，建房行为可以合法化。以下是对此问题的详细分析：
一、违法性分析
耕地保护原则：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》第三十七条，非农业建设应节约使用土地，禁止占用耕地进行建窑、建坟或擅自在耕地上建房等破坏性行为。这一规定旨在保护耕地资源，确保国家粮食安全和农业可持续发展。
- 《基本农田保护条例》第十七条也明确规定，禁止在基本农田保护区内进行建房等破坏活动。
耕地用途限定：
- 耕地主要用于种植农作物，有严格的保护制度，不得随意改变其用途，特别是不能用于建房。这是为了维护粮食安全和生态平衡，防止耕地资源的过度开发和破坏。
二、特殊情况下的合法性
- 在特定情况下，如所在村没有其他符合规划的宅基地可分配，且该耕地已依法经过农用地转用审批手续转为建设用地时，村民可按相关规定申请宅基地建房。
- 申请需经乡镇政府审核，并由县级政府批准后，建房行为方为合法。这一流程确保了建房活动的合法性和合规性，避免了违法建房带来的法律后果。
三、违法建房的法律后果
行政处罚：
- 未经批准擅自在耕地上建房，县级以上人民政府农业农村主管部门或自然资源主管部门有权责令退还非法占用的土地，并限期拆除在非法占用土地上新建的房屋。
- 此外，还可能面临罚款等行政处罚，具体罚款数额根据违法情节和地区差异而定。
刑事责任：
- 若非法占用耕地数量较大，造成耕地大量毁坏，还可能构成非法占用耕地罪，依法追究刑事责任。根据《最高人民法院关于审理破坏土地资源刑事案件具体应用法律若干问题的解释》，非法占用基本农田五亩以上或者非法占用基本农田以外的耕地十亩以上，且造成耕地大量毁坏的，即构成犯罪。
四、建议与合规指引
咨询与审批：
- 如确需在耕地上建房，应先向当地村委会或相关部门提出申请，了解相关政策和规定，并按照规定程序申请审批。这是确保建房行为合法合规的关键步骤。
合规性检查：
- 在申请过程中，需确保所建房屋符合乡（镇）土地利用总体规划和村庄规划，且满足“一户一宅”原则和宅基地面积标准。这是避免违法建房的重要前提。
避免违法风险：
- 切勿未经批准擅自行动，以免面临法律处罚和耕地破坏的严重后果。在建房前务必充分了解法律规定，确保合规性。
总结来说，在自己耕地上未经批准擅自盖房是违法的，可能面临行政处罚甚至刑事责任。但在特定条件下，经过法定审批程序，建房行为可以合法化。因此，建议有建房需求的个人或单位务必先了解并遵守相关法律规定，确保建房行为的合法性与合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。