结论概述：
- 若协议中明确约定了法定程序不能完成时协议自动失效，且双方均无过错，则一般不承担违约责任。
- 若因一方过错导致法定程序不能完成，则过错方需承担违约责任。
- 若协议自动失效后，双方仍有其他损失，且该损失与协议失效有直接因果关系，则可能需根据实际情况承担相应责任。
详细分析：
首先，我们需要明确协议中的“法定程序不能完成”和“约定时间逾期协议自动失效”这两个条款的含义。这通常意味着，如果双方约定的某项法定程序（如审批、登记等）在约定时间内未能完成，那么协议将自动失效。这种条款在合同中并不罕见，它通常是为了保护双方免受因无法控制的外部因素导致的合同履行障碍的影响。
双方均无过错的情况：
- 如果法定程序不能完成是由于不可抗力、政府行为或其他双方均无法控制的原因导致的，且双方均已尽到合理努力去促成法定程序的完成，那么在这种情况下，协议自动失效通常被视为双方均无过错。根据合同法的原则，双方在这种情况下一般不承担违约责任。
一方存在过错的情况：
- 如果法定程序不能完成是由于一方过错（如未按时提交申请、提供虚假材料等）导致的，那么过错方需要承担违约责任。这是因为过错方违反了协议中的义务，导致协议无法按照约定履行。违约责任的具体形式可能包括赔偿损失、支付违约金等，具体取决于协议中的约定和法律规定。
协议失效后的其他责任：
- 即使协议因法定程序不能完成而自动失效，双方仍可能因协议失效前的行为或状态而承担其他责任。例如，如果一方在协议失效前已经收到了对方的预付款或定金，但因协议失效而无法履行相应义务，那么该方可能需要退还预付款或定金，并可能需承担因退还而产生的合理费用。
- 另外，如果协议失效导致双方遭受了其他损失（如因准备履行协议而产生的费用、因协议失效而错过的商业机会等），且该损失与协议失效有直接因果关系，那么双方可能需根据实际情况承担相应责任。这种情况下，责任的承担可能需要根据具体案情和法律规定进行判断。
建议与行动：
- 审查协议条款：首先，双方应仔细审查协议中的相关条款，特别是关于法定程序、约定时间和违约责任的部分，以明确各自的权利和义务。
- 收集证据：如果一方认为另一方存在过错导致法定程序不能完成，那么应收集相关证据以支持自己的主张。
- 协商解决：在协议失效后，双方应首先尝试通过协商解决争议，以避免不必要的法律纠纷和成本。
- 寻求法律帮助：如果协商无果，双方可以寻求法律帮助，通过诉讼或仲裁等方式解决争议。
法律依据：
- 虽然具体的法律依据可能因国家和地区而异，但一般来说，合同法的原则（如诚实信用原则、公平原则等）和关于违约责任的规定（如赔偿损失、支付违约金等）都是处理此类问题的基本依据。
- 在中国，可以参考《中华人民共和国民法典》中关于合同的规定，特别是关于合同效力、违约责任和合同解除的部分。
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