员工在上班期间患恶性肿瘤，公司需依法承担相应责任并妥善处理，具体处理方式需结合实际情况分情况讨论：

1. 若恶性肿瘤被认定为工伤
   根据《工伤保险条例》第十五条，员工在工作时间和工作岗位突发疾病死亡，或在48小时内经抢救无效死亡的，视同工伤。但恶性肿瘤通常属于慢性疾病，若员工能证明患病与工作环境、职业危害存在直接因果关系（如长期接触致癌物质），可申请工伤认定。

   • 公司义务：需在30日内为员工申请工伤认定，配合提供劳动合同、考勤记录、医疗诊断证明等材料；若未及时申请，员工或其家属可在1年内自行申请，期间产生的医疗费用等可能由公司承担。
     
   • 员工权益：若被认定为工伤，可享受工伤保险待遇，包括医疗费、康复费、停工留薪期工资（原工资福利待遇不变）、伤残补助金（根据伤残等级）等。

2. 若恶性肿瘤未被认定为工伤，但员工符合医疗期条件
   根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工因患病或非因工负伤停止工作治病休息时，公司不得解除劳动合同，且需支付医疗期工资（不低于当地最低工资的80%）。

   • 医疗期时长：根据员工实际工作年限和在本单位工作年限，医疗期为3-24个月（例如：实际工作10年以下，在本单位工作5年以下的为3个月；5年以上的为6个月）。
     
   • 公司义务：需安排员工休医疗期，不得以“不能胜任工作”等理由解除合同；医疗期满后，若员工仍无法从事原工作或另行安排的工作，公司可提前30日书面通知或支付1个月工资后解除合同，并支付经济补偿金（按工作年限，每满1年支付1个月工资）。

3. 若员工医疗期满后仍无法工作，公司解除合同的限制
   根据《劳动合同法》第四十二条，员工患病或非因工负伤，在规定的医疗期内，公司不得解除合同。但医疗期满后，若员工无法从事原工作或另行安排的工作，公司可依法解除合同，但需满足以下条件：

   • 提前30日书面通知员工或支付1个月工资（代通知金）；
     
   • 支付经济补偿金（工作年限×月工资）；
     
   • 若员工属于“老弱病残”等困难群体，公司需优先安排再就业或提供额外帮助。

4. 公司需注意的合规风险

   • 程序合规：解除合同需严格履行法定程序（如通知工会、听取员工意见等），否则可能构成违法解除，需支付2倍经济补偿金的赔偿金。
     
   • 证据保留：公司需保留员工医疗期证明、劳动合同、工资记录等材料，以备劳动仲裁或诉讼时使用。
     
   • 人文关怀：建议公司主动与员工沟通，了解其需求，在合法范围内提供帮助（如调整工作岗位、协助申请社会救助等），避免引发劳动纠纷。

建议：若员工或公司对恶性肿瘤是否属于工伤、医疗期时长、解除合同合法性等问题存在争议，可进一步提供具体信息（如员工工作年限、患病与工作关联性、公司处理方式等），我将结合实际情况为您详细分析。