针对员工经常迟到未打卡的问题，这确实是一个需要细致处理的管理挑战。首先，我们要明确的是，按时上下班是员工的基本职业道德，也是公司规章制度的重要组成部分。然而，在处理这类问题时，公司必须确保自身的规章制度合法、合理，并且已经明确告知员工。

一、规章制度需合法合理且明确告知

1. 合法性：公司的考勤制度必须符合国家法律法规的规定，不能侵犯员工的合法权益。例如，不能随意将迟到半小时就记为半天旷工，这样的规定可能因过于苛刻而被认定为不合理，从而在法律上站不住脚。

2. 合理性：规章制度在合法的基础上，还需要具备合理性。这意味着制度不能过于僵化，应该考虑到实际工作的灵活性和员工的合理需求。比如，对于偶尔因特殊情况迟到的员工，公司可以采取警告、扣分等柔性管理措施，而不是直接记为旷工。

3. 明确告知：公司必须确保员工已经明确知晓并理解了考勤制度。这可以通过将制度写入员工手册、劳动合同附件，或者通过培训、会议等方式进行传达。如果员工对制度不知情，那么公司就不能以违反制度为由对其进行处罚。

二、处理迟到未打卡的具体措施

1. 初步沟通：当发现员工经常迟到未打卡时，公司应首先与员工进行沟通，了解迟到的原因。如果是由于交通拥堵、家庭突发情况等不可抗力因素导致的迟到，公司可以给予一定的理解和宽容。

2. 警告与记录：如果员工迟到是由于个人原因且频繁发生，公司应给予正式的警告，并记录在案。警告可以采取书面形式，明确告知员工迟到的严重性以及可能面临的后果。

3. 扣分或罚款：根据公司的考勤制度，可以对迟到的员工进行扣分或罚款。但需要注意的是，罚款的金额必须合理，不能过高，否则可能被视为侵犯员工的合法权益。

4. 绩效评估：在员工的绩效评估中，迟到情况应作为一个重要的考量因素。频繁迟到的员工可能在绩效评估中得分较低，从而影响其晋升、加薪等职业发展。

5. 解除劳动合同：如果员工迟到情况严重，且经过多次警告和处罚后仍无改善，公司可以考虑解除劳动合同。但在此之前，必须确保公司的规章制度已经明确告知员工，并且解除劳动合同的决定符合法律法规的规定。

三、案例借鉴与风险提示

从您提供的案例中，我们可以看到，如果公司没有明确告知考勤制度，或者制度本身存在不合理之处，那么在处理员工迟到问题时可能会面临法律风险。例如，在第一个案例中，公司因为未明确告知考勤制度且未尽到管理责任而被判违法解除劳动合同；在第二个案例中，公司因为将迟到半小时记为半天旷工而被认定为规定不合理。

因此，公司在处理员工迟到未打卡问题时，必须确保自身的规章制度合法、合理且明确告知员工。同时，在采取处罚措施时也要谨慎行事，避免因为处理不当而引发法律纠纷。

综上所述，处理员工经常迟到未打卡的问题需要公司从规章制度、沟通警告、绩效评估等多个方面入手，确保处理过程合法、合理且有效。